مدل شکلی ناهمسانگرد جدید برای لکه های پروتیینی در تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 567

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICBME22_031

تاریخ نمایه سازی: 7 اسفند 1396

چکیده مقاله:

مدل های ریاضی و شکلی از لکه های پروتیینی در تشخیص و ناحیه بندی تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی و نیز در تولید مصنوعی این تصاویر کاربرد وسیع دارد. اکثر روش های موجود به مدل سازی لکه های پروتیینی همسانگرد پرداخته اند و در مدلسازی لکه های نامتقارن عملکرد خوبی ندارند. در این تحقیق مدل شکلی ناهمسانگرد جدیدی برای بیان لکه های پروتیینی ارایه شده است، که قادر است با دقت بالا لکه های پروتیینی که دارای عدم تقارن در جهات مختلف هستند را مدل نماید. پارامترهای مدل پیشنهادی به کمک روش گرادیان نزولی و بر پایه تخمین درست نمایی محاسبه شده است. جهت ارزیابی روش پیشنهادی، باقیمانده ی حجمی تصاویر اصلی و تخمین زده شده توسط روش پیشنهادی و روش های مقایسه ای برای 403 لکه ی واقعی که در 10 گروه بر اساس حجم لکه گروه بندی شده اند محاسبه و بررسی شده است. بر اساس نتایج، میانگین باقیمانده ی خطای مدل پیشنهادی، مدل گوسی چهارگانه، گوسی دوگانه و گوسی متقارن به ترتیب (فرمول در متن اصلی مقاله) است. با توجه به خطای کمتر مدل پیشنهادی، این روش در تخمین لکه ها به ویژه لکه های نامتقارن از دقت بالاتری برخوردار است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

سینا شامخی

دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

محمد حسین میران بیگی

دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

بهاره آذریان

آزمایشگاه پروتیین- شیمی مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، انستیتوپاستور ایران

آذریان گویا

دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران