شناسایی مولکولی پوتیویروس های مهم آلوده کننده گیاهان زراعی در شمال ایران

پوتیویروس ها (تیره Potyviridae) یکی از بزرگترین گروه های ویروس های گیاهی با بیشترین اهمیت اقتصادی بوده و عامل 40 % بیماری های ویروسی در گیاهان می باشند. به دلیل آسانی انتقال این ویروس ها، ردیابی آنها به منظور کنترل بیماری های ناشی از آنها مهم می باشد. بدین منظور، تعدادی نمونه برگی دارای علایم ویروسی از گیاهان مختلف استان های مازندران و گلستان جمع آوری RNA کل آنها استخراج شد در آزمون RT-PCR با یک جفت آغازگر دژنره مربوط به ژن CI پوتیویروس ها، قطعه ای به طول bp 680 تکثیر گردید. محصولات PCR جدایه ها بسته به نوع گیاه میزبان همسانه سازی و تعیین توالی شدند. آنالیز بلاست توالی ها نشان داد که هر یک از آنها با توالی یک پوتی ویروس مشابهت دارند و قطعات توالی یابی شده متعلق به ویروس Y سیب زمینی PVY از سیب زمینی، گوجه فرنگی، ویروس موزاییک زرد کدو ZYMV کدو، گوجه فرنگی، ویروس موزاییک هندوانه WMV از کدو، هندوانه)، ویروس موزاییک معمولی لوبیا BCMV از لوبیا، ویروس موزاییک معمولی نکروز لوبیا BCMNV لوبیا، ویروس موزاییک سویا SMV (از لوبیا)، ویروس موزاییک نیشکرSCMV از ذرت، نیشکر و ویروس موزاییک کوتولگی ذرت MDMV از ذرت است. در این تحقیق با استفاده از آغازگرهای دژنره مربوط به پوتی ویروس ها، گونه های مختلف مربوط به این جنس که باعث ایجاد آلودگی در طیف مختلفی از گیاهان می گردند شناسایی گردید. استفاده از آغازگرهای دژنره نه تنها ردیابی سریع پوتی ویروس های زیادی را تسهیل کرده بلکه توالی یابی قسمتی از ژنوم برای اهداف تاکسونومیکی را نیز ممکن ساخته است

کلیدواژه ها:

پوتیویروس ، آغازگر دژنره ، RT-PCR ، همسانه سازی ، توالی یابی