ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Development of a multiplex PCR for detection and identification of aquatic mycobacteria

سال انتشار: 1387
کد COI مقاله: ICAAHMD01_045
زبان مقاله: انگلیسیمشاهد این مقاله: 1,495
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله Development of a multiplex PCR for detection and identification of aquatic mycobacteria

F Pourahmad - Institute of Aquaculture, University of Stirling, Stirling, UK AND School of Veterinary Medicine, Ilam University, Ilam, Iran
K D Thompson - Institute of Aquaculture, University of Stirling, Stirling, UK
A Adams - Institute of Aquaculture, University of Stirling, Stirling, UK
R H Richards

چکیده مقاله:

Objective: The mycobacteria that are most frequently associated with mycobacteriosis in fish are M. marinum, M. fortuitum and M. chelonae. Mycobacterial species are traditionally differentiated on the basis of their phenotypic characteristics which are very slow and labour-intensive procedure and suffer from inaccuracy. Advances in polymerase chain reaction (PCR) have resulted in widespread use of this technique. More recently a method termed multiplex PCR has been developed to include more than one pair of primers in which more than one target sequence is amplified. In this study a multiplex PCR was developed aiming at detection and identification of 3 aforementioned mycobacteria species. Method & Materials: To test the specificity of the multiplex PCR, a total of 59 mycobacterial isolates and type strains were screened. The specificity of the multiplex PCR assay was further tested using 4 reference strains and a number of field isolates of mycobacteria and 23 non-mycobacterial reference and field isolates. Using the Primer Select module in the Lasergene, Version 6.0, (DNASTAR), a series of genus and speciesspecific primers from the 16S rRNA and the hsp65 genes was designed. Results & Conclusion: DNA extracted from different species of mycobacteria reacted with the appropriate set of primers and no cross-reactivity was observed between different mycobaterial species or with any of the non-mycobacterial species. The level of sensitivity obtained for this multiplex PCR is noteworthy. The same sensitivity limit for the assay was achieved for both culture extracted DNA and fish tissues spiked with bacterial suspensions; this indicated that the assay is appropriate for use on field samples, i.e., frozen or fresh tissues. The rapidity and sensitivity of this multiplex PCR strongly supports the use of the assay as an efficient alternative to culture and biochemical tests. This one-step, single-tube multiplex PCR reaction not only minimizes the chance of contamination but also saves time and is cost-effective. The multiplex PCR protocol developed in this study is highly sensitive and unlike other PCR-based methods such as nested-PCR, hybridisation or restriction enzyme analysis does not require extra procedures; hence, it enables rapid detection and identification of the most common aquatic mycobacteria. However, due to sequence similarity of mycobacterial 16S rRNA gene, further analysis of mycobacterial isolates examined in this study such as sequence determination of different genes is required in future.

کلیدواژه ها:

Detection & identification, Multiplex PCR, Aquatic Mycobacteria

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/65401/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Pourahmad, F و Thompson, K D و Adams, A و Richards, R H,1387,Development of a multiplex PCR for detection and identification of aquatic mycobacteria,اولین کنگره بین المللی مدیریت بهداشتی و بیماریهای آبزیان,تهران,,,https://civilica.com/doc/65401

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1387, Pourahmad, F؛ K D Thompson و A Adams و R H Richards)
برای بار دوم به بعد: (1387, Pourahmad؛ Thompson و Adams و Richards)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 3,477
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی