ردیابی مولکولی باکتری های همراه با عارضه زوال مرکبات در جنوب استان کرمان

عارضه زوال مرکبات در سالهای اخیر سبب مرگ تعداد زیادی از درختان مرکبات در نواحی کوهپایه ای جنوب استانکرمان شده است. اتیولوژی این عارضه تاکنون مشخص نشده است. این پژوهش با هدف بررسی نقش باکتری های اندوفیتدر این عارضه انجام شد. برای این منظور نمونه های گیاهی از اندامهای مختلف درختان مرکبات سالم و مبتلا به عارضهزوال در منطقه نراب، جیرفت جمع آوری شد. جداسازی باکتریهای اندوفیت به دو روش کشت نمونه گیاهی در محیطکشت مصنوعی و ردیابی مولکولی باکتری در بافت گیاهی انجام و شناسایی آنها براساس تعدادی از آزمون های افتراقیباکتری شناسی و تکثیر و تعیین توالی قطعه ای از ناحیه 16S rDNA مورد بررسی قرار گرفت. واکنش زنجیره ایپلیمراز با استفاده از جفت آغازگر F342 / R806 انجام گرفت. در تمام نمونه های مورد بررسی و باکتریهای جداسازیشده قطعه ای از ژنوم باکتری به اندازه 388 جفت باز تکثیر گردید. نتیجه تعیین توالی قطعات ژنومی شده نشان داد کهنمونه های مورد بررسی متعلق به باکتری های Bacillus trquilensis ، Lysinibacillus sp ، Pseudomonas fluorescens ، Bacillus licheniformis ، mojavensis Bacillus ، Bacillus cereus ، Laysinibacillus fusiformis, ، Bacillus megaterum بودند. هیچگونه تفاوت قابل تمایزی از نظر فلور باکتریایی بین درختان سالمو مبتلا به زوال مشاهده نشد و گونه های باکتری شناسایی شده هم در درختان سالم و هم در درختان آلوده وجود دارند.لذا این باکتری ها صرفا به عنوان اندوفیت شناسایی و معرفی می شوند و نقشی در بروز عارضه زوال مرکبات ندارند.

کلیدواژه ها:

باکتری اندوفیت ، مرکبات ، بیماری زوال ، ریزوسفر