اعتبار سنجی پایدار استخراج امضاهای بیان ژن

شناسایی ژن های کاندید معتبر فنوتیپ خاص، مانند سرطان، یکی از چالش های عمده در زمینه بیوانفورماتیک بوده است. با توجه به مجموعه داده ریزآرایه DNA ، روش های سنتی انتخاب ویژگی های لیستی از ژن ها که به طور قابل توجهی تحت تغییرات داده های آموزشی متفاوت بسیار متغیر هستند را تولید می کند. که بی ثباتی مانع از اعتبار یافته های تحقیقاتی می شود و تردیدهایی را در مورد قابلیت اطمینان چنین روش هایی ایجاد می کند. در این مطالعه، ما یک چارچوب برای استخراج امضای ژنومی پایدار ارایه می کنیم. روش پیشنهادی ثبات در مرحله اعتبار سنجی، مستقل از انتخاب ویژگی و روش های طبقه بندی استفاده شده را به اجرا می گذارد. معنای آماری مجموعه ژن انتخاب شده است نیز مورد بررسی قرار می گیرد. نتایج حاصل از این مطالعه اهمیت مسایل مربوط به ثبات در امضای ژنومی را، فراتر از قابلیت های پیش بینی خود نشان می دهد. برای اینکار ما از یک مجموعه نرم افزاری که برای پیاده سازی و ساخت برخی از روش های پیش بینی و یک روش محاسباتی بر اساس نمایه سازی معنایی نهفته (LSI) توسعه یافته کمک می گیر یم که هم استنباط و هم تفسیر در دسترس برای جستجوی شباهت ژن ها از لحاظ معنایی را ممکن می سازد.

کلیدواژه ها:

امضای بیان ژن ، خوشه بندی ، پایداری ، بیو انفورماتیک