مطالعه برهمکنش HLA G با دو گیرنده LILRB1 و LILRB2

لاتین G HLA مولکولی از کلاس یک MHC دسته غیرکلاسیک می باشد که برهمکنش آن با رسپتورهای LILRB1 و LILRB2 در مهار پاسخ ایمنی از اهمیت بالایی برخوردار میباشد. تمایل اتصال HLA G به LILRB2 بیشتر از LILRB1 میباشد. در این میان شناخت دقیق این برهمکنش میتواند در درمان بیماریها و اختلالات بسیاری همچون سقط جنینهای خودبخودی، درمان بیماریهای خودایمنی و ویروسی به محققین کمک کند. در این پژوهش با کمک تکنیک داکینگ کمپلکس HLA G و LILRB1 رامدلسازی کردیم. ساختار کریستالوگرافی کمپلکس HLA G-LILRB2 نیز در بانک داده پروتئین موجود میباشد. سپس جهت بررسی دقیق برهمکنشهای مذکور، با استفاده از روشهای شبیهسازی دینامیک مولکولی، رفتار این دو کمپلکس را در محیط آبی شبیهسازی کرده و رفتار کمپلکسها بررسی نمودیم. سپس بوسیله نرمافزار PISA ساختار نهایی این شبیهسازیها را مورد آنالیز و بررسی قرار دادیم. نتایج حاکی از پایداری و تراکم ساختاری بیشتر و انعطاف پذیری کمتر در کمپلکس 2 ( HLA G-LILRB2 )نسبت به کمپلکس 1 ( HLA G-LILRB1 ) بود. علاوه بر این مشخص شد که سطوح برهمکنش در این کمپلکس نیز هیدروفوبتر و وسیعتر میباشند.

کلیدواژه ها:

مهار پاسخ ایمنی ، کمپلکس HLA G-LILRB2 شبیهسازی دینامیک مولکولی ، هیدروفوب