بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای انار درجزین با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 560
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICDAT01_178
تاریخ نمایه سازی: 12 تیر 1395
چکیده مقاله:
در این آزمایش از 20 جمعیت مختلف انار Punica Granatum L درجزین شامل سه منطقه متفاوت چهل تن، درج محله (درجز ین) و پشته، جهت ارزیابیهای تنوع ژنتیک ی استفاده شد . نمونه برداری برگ از اواسط مرداد ماه انجام گرفت . به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در سطح DNA از 10 آغازگر RAPD و برای استخراج DNA ژنومی از کیت استخراج شرکت GenetBio استفاده شد . پس از استخراج DNA کیفیت و کمیت آن ها بر روی ژل آگارز 2 درصد الکتروفورز و با غلظت نشانگر استاندارد Size marker مورد بررسی گردید . سپس PCR انجام شد . پس از اتمام چرخه های PCR محصولات روی ژل آگارز 1/5 درصد بارگذاری شدند و عکس برداری توسط دستگاه ژن داک انجام گردید. داده های مولکولی برای تجزیه و تحلیل به صورت امتیازهای صفر (عدم وجود باند ) و یک (وجود باند) برای هر آغازگر از روی ژل ثبت شدن د . ماتریس تشابه جاکارد، تجزیه کلاستر به روش UPGMA و آزمون منتل برای محاسبه ضریب همبستگی کوفنتیک توسط نرم افزار 2.02e ؛ NTSYS-pc,و در نهایت تجزیه واریانس مولکو لی و تجزیه PCoA توسط نرم افزار 6.501 GenAlEx محاسبه گردید . از بین 10 آغازگر RAPD ؛ 8 آغازگر باند ایجاد نمودند و از 2 آغازگر باندی ایجاد نش د . بیشترین باند از آغازگر OPAD-16 (10 باند) کمترین تعداد از آغازگرهای TIMBB-15 و TIMBC-08 (4باند) حاصل شد . از بین مجموع 51 باند قطعه های DNA امتیاز بندی شده 34 باند (69 درصدد) چندشکلی نشان دادند. نتایج تجزیه کلاستر ، جمعیتهای انار بررسی شده را در سطح 0/58 به شش گروه مجزا تفکیک نمود . ضریب کوفنتیک محاسبه شده توسط آزمون منتل (0/89 =r) مناسب بودن برازش ماتریس تشابه جاکارد را بر نمودار دندروگرام تائید نمو د . نتایج آنالیز واریانس مولکولی نشان داد که در مجموع سهم تنوع درون مناطق از تنوع بین آنها بیشتر اس ت . این آزمایش نشان داد که نشانگر RAPD برای گروهبندی جمعیتهای انار یک تکنیک موثر و مفید اس ت و از داده های مولکولی آن می توان در برنامههای اصلاحی استفاده نمود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
ابوذر جعفری چاشمی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان
سید محمدمهدی مرتضویان
استادیار گروه علوم زراعی و اصلاح نباتات، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :