رویکردی نوین در دادههای بیان ژنی با روش خوشه بندی فازی

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 517

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CITCONF03_043

تاریخ نمایه سازی: 12 تیر 1395

چکیده مقاله:

پیچیدگی شبکههای زیستی و تعداد زیاد ژنها در مجموعه دادههای ریز آرایه منجر به چالشهای فراوان در زمینه تحلیل دادههای بیان ژنیشده است. الگوریتمهای خوشهبندی که ژنهای مشابه یکدیگر را به هدف تحلیل عملکرد ژنها گروهبندی مینماید اولین قدم برایرویارویی با این چالشها میباشد. بطور کلی روشهای خوشهبندی فازی برای تحلیل دادههای بیان ژنی مناسبتر میباشند زیرا گروههایزیستی به طور ذاتی دارای هم پوشانی بوده و به میزان قابل توجهی نویز در آنها مشاهده میشود. در همین راستا در این رساله از یکروش قدرتمند فازی جهت خوشه بندی داده های بیان ژنی استفاده شده است. در پایان نیز میزان دقت الگوریتم پیشنهادی بر روی چندمجموعه داده ریز آرایه توسط چند معیار درستی بررسی شده و با چند روش خوشهبندی فازی شناخته شده مقایسه گردیده است. الگوریتمپیشنهادی دقت اجرای بالاتری را نسبت به سایر روش ها نشان داده است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

ناصر دستوان

گروه کامپیوتر، ، دانشگاه آزاد اسلامی واحد سیرجان، سیرجان، ایران

محمد صادق حاج محمدی

گروه کامپیوتر، واحدسیرجان، دانشگاه آزاد اسلامی، سیرجان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • شاکری، محمد تقی، احسان صباغیان، حبیب الله اسماعیلی، مقایسه روش‌های ...
  • M. Luscombe, D. Greenbaum, M. Gerstein, 0What is Bioinformatics ? ...
  • M. Eisen and P. Brown, :DNA Arrays for Analysis of ...
  • F. Beltrame, A. Pap adimitropoulos _ Ivan Porro , S. ...
  • M.M Babu, _ Introduction to Microarray Data Analysis", Microarray Data ...
  • D.Jiang, C. Tang, and A. Zhang, " Cluster Analysis for ...
  • Method for Clustering Gene Epress ion Data Based on Graph ...
  • L. Fu and E. Medico , 'FLAME, a novel fuzzy ...
  • M. S. Yang, K. L. Wu, J. N. Hsieh, and ...
  • J. C. Bezdek, "Cluster validity with fizzy sets, " J. ...
  • R. Krishnapuram and J.M.Keller, "Apossibilistic approach to clustering, IEEE Trans. ...
  • M. Halkidi, Y. Batistakis, M. Vazirgiannis, "On Clustering Validation Techniques", ...
  • F. Kovacs, C. Legany and A. Babos, "Cluster Validity Measuremet ...
  • نمایش کامل مراجع