مقایسه بیوانفورماتیکی ویژگی های ایزوفرم های مختلف ژن DREB در گیاهان مختلف

به منظور بررسی رایانه ای توالی اسیدآمینه ایزوفرم های مختلف ژن DREB و مقایسه آن ها در بین گیاهان مختلف، توالی های اسیدآمینه ای هریک از ژن ها از سایت www.uniprot.org جمع آوری شد. سپس با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی تفاوت ها و شباهت های موجود بین توالی ها مشخص شد. از میان 34 ویژگی مورد بررسی مشاهده شد که پروتئین های دو ایزوفرم DREB2 و DREB1 درگیاهان مختلف در 10 ویژگی باهم اختلاف دارند. نتایج نشان داد که گلوتامین و لیزین، سیستئین و سرین که جزء اسیدآمینه های آبدوست هستنددر توالی اسید آمینه ای DREB2 بیشتر و همچنین لوسین که اسیدآمینه ای آبگریز و آلیفاتیک هست در DREB1 بیشتر است. شاخص آلیفاتیک که به عنوان یک عامل مهم به منظور برآوردمقاومت پروتئین ها در برابر حرارت می باشد در توالی های DREB1 بیشتر بود که دلیل آن فراوانی بیشتر اسید آمینه های آلانین، ایزولوسین، لوسین و والین که همگی جزء اسیدآمینه های آلیفاتیک می باشند و در DREB1 بیشتر است. همچنین بالا بودن میانگین شاخص پایداری پروتئینی مربوط به ژن DREB1 نشان دهنده ی پایداری بیشتر آن است. بررسی توالی ها نشان داد که تفاوت معنی داری بین شاخص های مانند طول ، وزن، بارمثبت و منفی و نقطه ایزوالکتریک وجودندارد.

کلیدواژه ها:

اسیدآمینه ، شاخص آلیفاتیک ، شاخص پایداری ، پروتئین DREB