شناسایی و تعیین خصوصیت ژن hmg در قارچ پنیسیلیوم بروی کامپکتوم

ژن hmgr رمز کننده ی پروتئین CoA - HMG ردوکتاز است که آنزیم کلیدی در مسیر موالونات به شمار می رود . به طوری که جهش های منجر به حذف عملکرد در آن، در قارچ ها به مرگ سلول خواهد انجامید . این ویژگی ، اساس طراحی طیف گسترده ای از داروهای ضد قارچی است . در این پژوهش ،شناسایی و تعیین خصوصیات ژن hmgr در قارچ پنیسیلیوم بروی کامپکتوم - سویه MUCL 19011 - (Pbhmgr) به روش TAIL-PCR گزارش می شو د. قالب خواندن باز، و ساختار سه بعدی پروتئین ، به ترتیب بانرم افزارهای تحت وبFGNESH و PHYR2 پیش بینی و در نرم افزارهای CLC Main Viewerو HEX بررسی شدند . از همگذاری قطعات بالا دست ، پایین دست ، و میان که درواکنش های جداگانه ی ژنوم قارچ به دست آمده بودند ، قطعه ژنومی Pbhmgr به طول نهایی bp430 به دست آمد . طبق پیش بینی نرم افزار FGENESH قالب خواندن باز این ژن به طول bp301 از نوکلئوتید 303 تا 3319 امتداد یافته است و دم پلی A- از نولکئوتید 3332 آغاز می شود . رونوشت این ژن ، به طول 2805 جفت باز، خاوی 3 اگزون به طول های 486، 1299، و 1020 جفت باز است و به پروتئینHMGR به طول 934 اسید آمینه و وزن مولکولی 100/78 کیلودالتون ترجمه می شود . پیش بینی و بررسی ساختار سه بعدی این پروتئین ، وجود سه دمین N ، L و S را در آن تایید کرد .

کلیدواژه ها:

HMG-CoAردوکتاز ، پنیسیلوم بروی کامپکتوم ، تعیین خصوصیت ژن