مشخصات مولکولی ژنوم کامل جذایه ایرانی ویروس بی بذری گوجه فزنگی

اخیرا ویروس بیبذری گوجه فرنگی از گیاهان زینتی از استان کرمان گزارش گردیده است . به منظور مطالعه و بررسی مولکولی ژنوم کامل جدایه ایرانی ویروس بی بذری گوجه فرنگی بک نمونه گیاه اطلسی آلوده به این ویروس در منطقه ماهان کرمان جمع آوری و آلودگی نسبت به TAV توسط آزمون DAS-ELISA تایید گردید . آر . ان .ای این جدایه استخراج و با استفاده از سیزده جفت آغازگر اختصاصی طولکامل ژنوم این جدایه در روش RT-PCR تکثیر و سپس در پلاسمید pTZ57R/T در دو سویه JM 107 باکتری Escherichia coli همسانه سازی گردید . بر اساس نتایج حاصل طول قطعات RNA-1، RNA-2 و RNA-3 جدایه ایرانی TAV ( Ker.Mah.P) به ترتیب 3357، 3035، 2192 و طول کامل ژنوم این جدایه معادل 8587 نوکلئوتید بدست آمد . زنوم این جدایه حاوی پنج قاب باز خواندنی شامل CP، MP ، 2a ، 2b، 1aمی باشد . موتیف های حفاظت شده ناحیه هلیکاز و نواحی حفاظت شده RdRp به ترتیب بر روی قطعات RNA-1 و RNA-2 قرار دارند . همچنین نواحی حفاظت شده UG tractو نایحه بین زنی (IR) نیز بر روی قطعه RNA-3 قرار دارد . در انتهای 3'UTR تمامی آر . ان . ای های جدایه مذکور نیز یک توالی حفاظت شده به طول 40 نوکلئوتید وجود دارد . علاوه بر این ژن 2b جدایه Ker.Mah.P نیز به طول 315 نوکلئوتید بوده که دارای 27 نوکلئوتید بیش تر از سایر جدایه های گزارش شده TAV در دنیا می باشد . نتایج خاصل از این تحقیق بیانگر آنست که ژنوم جدایه ایرانی ویروس TAV همانند سایر جدایه های این ویروس در دنیا دارای نواحی حفاظت شده می باشد .

کلیدواژه ها:

ویروس بیبذری گوجه فرنگی ، مشخصات مولکولی ، ناحیه حفاظت شده