تعیین ترادف ژنوم کامل دو جدایه ایرانی ویروس X سیب زمینی

ویروس X سیب زمینی (PVX) یکی از ویروس های رایج سیب زمین است . به منظرو مطالعه ژنوم کامل ویروس X سیب زمینی، دو جدایه KER.ZA.1 و KER.LA.2 از مناطق بردسیر و زرند کرمان جمع آوری و آلودگی آن ها به PVX به وسیله آزمون DAS-ELISA با استفاده از آنتی سرم چند همسانه ای مورد تایید قرار گرفت . ژنوم کامل دو جدایه با استفاده از هشت جفت آغاز گر اختصاصی توسط واکنش RT-PCR تکثیر شده و بعد از قرار دادن در پلاسمید pTZ57R/T به باکتری Escherichia coli سویه JM 107 منتقل گردید . بر اساس نتایج بدست آمده طول کامل ژنوم دو جدایه معادل 6315 نوکلئوتید و خاوی زن های RdRp، TGB1،TGB2، TGB3 و CP می باشد . مقایسه ترادف های بدست آمده نشان داد که میزان مشابهت ترادف نوکلئتیدی دو جدایه 98/3 درصد می باشد . نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر تشابه بالای ترادف نوکلئتیدی ژنوم آمینواسیدی ژن های این دو جدایه با یکدیگر می باشد .

کلیدواژه ها:

تعیین ترادف ژنوم کامل ، ویروس X سیب زمینی ، همسانه سازی