بررسی سیر تکاملی و همولوژی دومین های پروتئین پایرین
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 599
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0784
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
مقدمه: پروتئین پایرین از ژن MEFV که در 16p13.3 قرار دارد، کدمی شود و دارای 781 اسیدآمینه است. دمین پایین از خانواده دومین های مرگ بوده و دربین پروتئین های پیش التهابی مشترک است . از این رو بررسی دومین های این پروتئین و ارتباطات فیلوژنتیکی آنها، فهم بهتر تعاملات پروتئین ها در مسیر های التهابی و مکانیسم تکامل پروتئین را سبب می شود. روش ها: تاکنون مطالعه ای بر روی ارتباطات تکاملی و همولوژی بین دومین های مختلف پایرین صورت نگرفته است، بنابراین دراین تحقیق با استفاده از توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی گرفته شده از سایت NCBI و اطلاعات حفاظت شدگی دومین ها از سایت Pfam و استفاده از نرم افزار BioEdit درخت فیلوژنتیکی رسم شد. همچنین ترکیب نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی دومین ها از طریق نرم افزار MEGA5.5 بررسی شد. نتایج: دو مین های موردبررسی همولوژی داشته و دومین های NLRP4 و NLRP11 به یکدیگر شبیه و به NLRP8 در مقایسه باNLRP13 شبیه ترند ودومین NLRP4 قدمت بیشتری دارد. در بررسی تفاوت نوکلئوتیدی اگزون 2و 10 اگزون هیستیدین کمترین و لوسین، گلوتامیک اسید و سرین بیشترین میزان آمینو اسید در دومین ها هستند. گوانین بیشترین درصد و تیمین یا یوراسیل کمترین میزان را دارا می باشند.
نویسندگان
فریبا محبی
دانشجوی ارشد ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی
شیرین فریور
عضو هیئت علمی دانشکده علوم زیستی دانشگاه شهید بهشتی
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :