تجزیه و تحلیل ترجیح کدونی ژن های رمز کننده آنتی پورتر Na+/H+ واکوئلی در گیاهان مقاوم و حساس به شوری

به منظور بررسی و مقایسه ترجیح کدونی در ژن های رمز کننده آنتی پورتر Na+/H+ واکوئلی در گیاهان مقاوم و حساس به شوری، 50 ژن از 32 گیاه مقاوم به شوری مختلف و 50 ژن از 17 گیاه حساس به شوری مختلف از پایگاه داده NCBI گرفته شد. با استفاده از سایت های GENE INFINITY و Mobyle portal تعداد، فراوانی و سایر شاخص های مربوط به ترجیح کدونی اندازه گیری شدند. نتایج نشان داد که به طور کلی در گیاهان مقاوم به شوری میانگین فراوانی مربوط به کدون هایی بود که به نوکلئوتید تیمین ختم می شدند(34/26 درصد) و کمترین میانگین فراوانی مربوط به کدون هایی بود که به نوکلئوتید آدنین ختم می شدند(20/67 درصد) و در گیاهان حساس به شوری نیز بیشترین وکمترین میانگین فراوانی به ترتیب مربوط به کدون هایی بود که به نوکلئوتید تیمین و آدنین ختم می شدند( 31/32 درصد و 19/99 درصد) بررسی کدون های مترادف در اسید آمینه هایی که دارای بیش از 2 کدون بودند. در گیاهان حساس و مقاوم به شوری نشان داد که بین بعضی از کدون ها از لحاظ آماری در سطح 5 درصد و 1 درصد هم بستگی معنی دار وجود دارد. وجود هم بستگی بین کدون های مترادف نشان دهنده ی این است کمه ارتباطی بین مقدار فراوانی این کدون ها در توالی ژنومی وجود دارد. نتایج آزمون t جفت شده نشان داد که تعداد و میانگین فراوانی کدون ها بین گیاهان مقاوم و حساس به شوری تفاوت معنی داری ندارد.شاخص خای FOP و CBI بین دو گروه مقاوم و حساس در سطح 1 درصد متفاوت بود.

کلیدواژه ها:

ترجیح کدونی ، آنتی پورتر Na+/H+ واکوئلی ، گیاهان مقاوم به شوری ، گیاهان حساس به شوری