بررسی نقش موتیف N-terminal cxxc در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین در گیاهان فرا انباشتگر فلزات سنگین و غیر فراانباشتگر با استفاده از بیوانفورماتیک

چذب و تجمع فلزات سنگین در گیاهان فراانباشتگر و غیر فراانباشتگر متفاوت است که این تفاوت به ساختار پروتئین های موثر در این فرایندها برمی گردد. به همین منظور برای بررسی ساختار پروتئینی پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین در این دو گروه از گیاهان 111 توالی این پمپ در گیاهان فرا انباشتگر و غیر فرا انباشتگر از بانک اطلاعاتی ExPASY گرفته شد و با استفاده از برنامه های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد موتیف CXXC، فاصله بین موتیف ها، تنوع اسید آمینه ای بعد وقبل از این موتیف ها و سایر خصوصیات پروتئینی این پمپ ها بررسی شد. نتایج نشان دادند که هیچ ارتباطی بین میزان انباشتگری فلزات سنگین و اسید آمینه قبل از موتیف CXXC و میزان نزدیکی بین این موتیف و غشا وجود ندارد. در مقابل مشخص شد که بیشترین اثر روی میزان انباشتگری فلزات سنگین مربوط به تعداد موتیف CXXC در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین می باشد که در بسیاری از پژوهش های پیشین نیز به نقش تنظیمی این موتیف اشاره شده بود. نتایج نشان دادند که تعداد این موتیف در گیاهان حساس کمتر است در حالی که تعداد بیش از 3موتیف تنها در گیاهان گروه فراانباشتگر و متحمل مشاهده شد. همچنین مشخص شد که فاصله بین موتیف های CXXC در بین گروه های مختلف گیاهان مورد مطالعه متفاوت است.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، پمپ P1B-ATPase ، موتیف CXXC