آنالیز مسیرهای پایه شبکه متابولیسم مرکزی ایی. کولای

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 443

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0611

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

آنالیز مسیرهای پایه ابزار مفیدی برای شناسایی ساختار شبکه ی متابولیکی است که فنوتیپ سلولی را به ژنوتیپ متناظر آن مرتبط می کند. آنالیز مسیرهای پایه برای بررسی تولید اتانول و تود هسلولی در میکروارگانیسم ایی. کولای استفاده شد.برای این منظور شبکه متابولیسم مرکزی ایی. کولای با 61 واکنش ( 19 واکنش برگشت پذیر ) و 59 متابولیت ( 12 متابولیت تبادل و 47 متابولیت درونی)در نظر گرفته شد. 38662 مسیر پایه برای این شبکه بدست آمد که از این تعداد 32242 مسیر مربوط بهمسیرهای هوازی و 6420 مسیر مربوط به مسیرهای بی هوازی می باشد. با توجه به نتایج بدست آمده مشاهده شد که نسبت تعداد مسیرهای تولیدکننده همزمان اتانول و توده سلولی نسبت به تعداد کل مسیرها، در حالت بی هوازی بیشتر از مسیرهای هوازی است. هم چنین مشاهده شد که با افزایش مصرف اکسیژن، بازده تئوری تو لید اتانول کاهش و میزان تولید CO2 افزایش می یابد. به طوری که در مسیرهایی با بیشترین میزان مصرف اکسیژن(( 2/133g/gGLC) بیشترین میزان 2ذOذCذ (( 1/47g/gGLC) تولید شده است که همگی این مسیرها چرخ ههای درون سلولی م یباشند که در آن ها اکسیداسیون کامل صورت گرفته و تنها محصول آن CO2 می باشد.

نویسندگان

زهرا فضلعلی

تهران، دانشگاه علم و صنعت ایران، دانشکده مهندسی شیمی، دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی شیمی-بیوتکنولوژی

فرشته نعیم پور

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی شیمی-بیوتکنولوژی،استادیار دانشگاه علم و صنعت ایران و

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Trinh, C.T., Wlaschin, A. and Srienc, F., 2009, Elementary Mode ...
  • Schuster, S. and Hilgetag, S., 1994, On Elementary Flux Modes ...
  • Schuster, S., Hilgetag, C. and Fell, D., 1994, Detecting Elementary ...
  • Pfeiffer, T., S anc hez-Vald enebro, I., Nuno, J., Montero, ...
  • Schuster, S., Fellda, Dandekar, T., 2000, A General Definition of ...
  • Trinh, C.T., Unrean, P. and Srienc, F., 2008, Minimal Escherichia ...
  • Schuster, S., Dandekar, T. and Fell, D.A, 1999, Detection of ...
  • نمایش کامل مراجع