بررسی پلی مورفیسم rnL-F گونه های صنوبر Populus caspica و Populus alba منطقه غرب جنگل های هیرکانی شمال ایران

جنس صنوبر یکی از اعضا خانواده بید است. به مجموع گونه های جنس صنوبر poplar می گویند که یکی از گروههای اقتصادی مهم در بین درختان جنگلهای هیرکانی است که مورد بهره برداری قرار می گیرد، هیبریداسون وسیع درون گونه ایو تنوع مورفولوژیکی زیاد در این گروه مشکلاتی را در شناسایی تاکسونومیکی واحدها به منظور مقایسه مطالعات تکاملی و رده تشابه (Populus alba) با سفیدار (Populus caspica) بندی مطرح می سازد. گیاه شناسان معتقدند صنوبر سفید پلت مورفولوژیکی را نشان می دهد که موجب بروز اختلافاتی در شناسایی می گردد. هدف از این مطالعه، بررسی پلی مورفیسم بین trnL-trnF کلروپلاستی DNA بر اساس توالی نوکلئوتیدی از منطقه غیر کد کننده از P. caspica و P. alba دو گونه ی از برگ های فریز DNA است. نمونه های برگ از مناطق شمال غرب جنگل های هیرکانی ایران جمع آوری گردید. استخراج پلی مراز و Pfu با آنزیم (PCR) 1987 ) انجام شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز ) Doyle &Doyle شده با استفاده از روش تکثیر شده تعیین توالی گردید. نتایج حاصل از کروماتوگرام DNA انجام شد و قطعات UEUFF/UEUFR پرایمرهای آنالیز گردید. مقایسه توالی بدست آمده با دیگر Blast با استفاده از نرم افزار trnL-trnF پردازش شدند و توالی DNA توالی نشان داد که سفیدپلت دارای 547 جفت باز و سپیدار Clustal W توالی های صنوبر موجود در بانک ژن با استفاده از برنامه 2 549 جفت بازی دارد، همچنین این گونه ها، جفت نوکلئوتید های متفاوت و متغیری را دارند. برای مثال این نواحی در دیده شده است اما در سپیدار یک شکاف در این ناحیه وجود دارد و همچنین در چهار موقعیت T و 230 T سفیدپلت 417 که در سپیدار مشاهده شد در حالیکه ، سفیدپلت در این موقعیت ها شکاف مشاهده G367, A368, C369, C بازهای 370 می تواند یک مارکر مولکولی مناسب برای حل برخی از اختلاف نظرهای trnL-F گردید. لذا پیشنهاد می گردد که گیاهشناسان برای شناسایی گونه ها در این جنس ها باشد.

کلیدواژه ها:

PCR ، سپیدار ، سفیدپلت ، trnL-F ، پلی مورفیس