فیلوتایپینگ جدایه های اشریشیاکلی ازگله های شترهای اطراف کرمان و شهربابک

فیلوتایپینگ و آنالیز زمینه فیلوژنی جدایه های اشریشیاکلی روشی جهت تعیین سیر تکاملی و قابلیت بیماریزائی این TSPE4.C و 2 yjaA ،chuA باکتری است. بر اساس یافته های ژنوتیپی و با شناسائی حضور و ترکیب ژنهای و همچنین در هفت تحت گروه فیلوژنی D و B2 ،B1 ،A جدایه های اشریشیاکلی در چهار گروه اصلی فیلوژنیدسته بندی می شوند. هدف از این بررسی شناسائی فیلوتایپ های D و 2 D1 ،B2-2 ،B2-1 ،B1-1 ،A2 ،A1 شایع در جدایه های اشریشیاکلی از مدفوع شترها در منطقه کرمان و شهربابک بوده است. از 105 شتر نمونه های مدفوعی تازه تهیه شد با کشت در محیط های مناسب اشریشیاکلی جداسازی و با آزمایشات بیوشیمیائی تائید DNA ، بررسی شد. از جدایه ها PCR گردید. از هر نمونه مدفوع دو جدایه اشریشیاکلی در آزمایش مولتی پلکس بعنوان کنترل استفاده ECOR و 62 ECOR58 ، ECOR به روش لیز استخراج شده و از سویه های استاندارد 20 72/85) A گردید. از تمامی نمونه اشریشیاکلی جدا گردید 210 جدایه بررسی شده در سه فیلوتایپ اصلی فیلوژنی 18/57 درصد) انتشار داشتند که در چهار تحت گروه فیلوژنی دسته بندی شدند. ) D 8/85 درصد) و ) B درصد)، 1 39) D 18 جدایه) و 1 ) B1- 60 جدایه)، 1 ) A 93 جدایه)، 2 ) A بیشترین فراوانی به ترتیب متعلق به گروه 1 جدایه) بود. مطالعه مقایسه ای سویه های اشریشیاکلی جدا شده از دامی و سویه های شتر نشاندهنده وجود اختلاف معنی دار در انتشار گروههای فیلوژنتیکی است که این تفاوت ها علاوه بر گونه دامی در مناطق جغرافیائی مختلف متغیر است.

کلیدواژه ها:

شتر ، اشریشیاکلی ، فیلوتایپ