آنالیز فیلوژنتیکی تعدادی از جدایه های ایرانی ویروس موزائیک یونجه
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 576
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0085
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
به منظور شناسایی و تعیین جایگاه تکاملی برخی از جدایه های ایرانی ویروس موزائیک یونجه (AMV) از مزارع سیب زمینی گوجه فرنگی، فلفل، نخود، لوبیا و علف های هرز مزارع یونجه چندین استان کشور تعداد 775 نمونه جمع آوری شد و توسط آزمون سرولوژیکی ELISA مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع تعداد 17 نمونه آلوده به این ویروس شناسائی گردید. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی جدایه های مذکور در نقاط مورد مطالعه، ژن پوشش پروتئینی به اندازه 780 جفت باز با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی در روش RT-PCR تکثیر و سپس همسانه سازی شد. پس از همسانه سازی و تعیین ترادف ژن مذکور، جایگاه تکاملی جدایه های ایرانی در مقایسه با ترادف های موجود در بانک جهانی ژن تعیین گردید. نتایج حاصل بیانگر آنست که غیر از جدایه Ke. Ma. Pl سایر جدایه های ایرانی در گروه ІІ قرار می گیرند. در صورتیکه جدایه Ke. Ma. Pl در شاخه ای مجزا از سایر جدایه های ایرانی و جدایه های موجود در بانک ژن قرار می گیرد. درصد تشابه نوکلئوتیدی بین جدایه ها به میزان 99/8- 73/2% می باشد بطوریکه بیشترین میزان شباهت بین جدایه K2703 از کشور آمریکا و جدایه های ایرانی Ke. Or. Am و Ke. Si. Ru و کمترین میزان تشابه مربوط به جدایه AF294432 از کشور کره جنوبی با جدایه Ke. Ma. Pl مشاهده شد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
فاطمه منگلی
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین معصومی
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
جهانگیر حیدرنژاد
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
اکبر حسینی پور
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :