بررسی بیوانفورماتیکی ژن 3-هیدروکسی- 3-متیل گلوتاریل- کوآنزیم آ ردوکت (HMGR) در فندق (Corylus avellana)

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,170

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_336

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

متابولیتهای ثانویه ترکیباتی با مولکول حلقوی هستند که فرآورده های ثانویه چرخه های طبیعی رشد گیاه محسوب میشوند. ایزوپرنوئیدها (ترپنوئیدها) بزرگترین گروه فرآورده های ثانویه هستند. دو مسیر شناخته شده بیوسنتز ایزوپرنوئیدها در گیاهان شامل مسیر موالونات (MVA) و مسیر دئوکسیگزیلوز 5-فسفات/ 2- C- متیل- D-اریترول 4- فسفات (MEP) که مسیر مستقل از موالونات نامیده میشود است. آنزیم HMGR یکی از آنزیمهای کلیدی مسیر موالونات ، HMG-COA را به موالونات تبدیل میکند. تاکسول با نام عمومی پاکلی- تاکسول ازآلکالوئیدهای دیترپنویید طبیعی است و از طریق این دو مسیر تولید میشود. در این مطالعه با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی ویژگیهایی از قبیل وزن مولکولی، نقطه ی ایزوالکتریک، پپتیدهای سیگنالی، دمینهای مربوط به عبور از غشاء، ساختار ثانویه، ساختار سه بعدی پروتئین HMGR متعق به گونه های فندق، سرخدار، قارچ اندوفیت، انسان، موش و مگس سرکه و موتیف_های اختصاصی موجود در پروموتر این ژن مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که پروتئین HMGR در گونه های مذکور دارای سه ناحیه حفاظت شده است. براساس درخت فیلوژنی، بین گونه های گیاهی با سایر موجودات مورد مطالعهرابطه خویشاوندی وجود دارد که دلیلی بر اشتقاق گونه ها از یک جد مشترک میباشد. همچنین شناسایی عناصر تنظیمی موجود در پروموتر ژن HMGR با استفاده از برنامه PLACE وجود موتیفهای متعددی را نشان داد که احتمالا مسوول تنظیم فعالیت ژن هستند.

نویسندگان

مریم حیدری فر

کارشناس ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی

فاطمه دهقان نیری

استادیار دانشگاه بین المللی امام خمینی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bemani E, Ghanati F., Yousefzade Boroujeni L. and Khatami . ...
  • Chotani G., Dodge T., Hsu A., Kuomar M., Richard L, ...
  • Darabi M, M. Nejad A, N.Zadeh G. Bioinformatics study of ...
  • Omidbaigi R., Production and processing of medicinal plants, 2007, In ...
  • Qaderi A., Omidi M., Etminan A, Oladzad A., Ebrahimi C., ...
  • Qaderi A., Omidi M., Oladzad A., Engineering secondary metabolites in ...
  • Schmeda -Hirschmann. G., Hormazabala _ Rodriguez J.A. and Theodulor C, ...
  • Shanker Dubey V., Bhalla R. and Luthra R. An overview ...
  • Xiong Z., Yang Y., Zhao N., Wang Y. Diversity of ...
  • Wei Y., Zhou X., Liu L., Lu J., Wang Z., ...
  • Wei Y., Zhou X., Liu L., Lu J., Wang Z., ...
  • Wang Y., Guo B., Zhang F., Yao H., Miao Zhiqi ...
  • Zhao J., Zhao L, Wang J., Shan T., Zhong L., ...
  • Zhao K., Ping W., Li Q., Hao S., Zao L. ...
  • نمایش کامل مراجع