کاربرد بالینی تعیین توالی اگزوم در تشخیص بیماریهای وراثتی نامشخص

تشخیص صحیح بیماریهای نادر خصوصا در موارد با علائم آتیپیک مشکل است. برای بیمارهای با هتروژنیتی ژنتیکی، شناسایی ژن عامل بیماری با روش تعیین توالی سانگر کار زمان براست. تعیین توالی اگزوم در حوزه پزشکی معمولاً برای شناسایی ژنهای عامل بیماری به کارگرفته میشود. در این پژوهش کارایی روش تعیین توالی اگزوم برای تشخیص بیماریها مورد بررسی قرار گرفت. تعیین توالی اگزوم برایدو خانواده –یکی با دو فرزند مبتلا و دیگری با یک فرزند مبتلای زنده- انجام شد.در هر خانوادهDNA از گلبولهای سفید افراد بیمار و والدین منسوب غیرمبتلای آنها استخراج شد.اگزونها ابتدا غنیسازی و سپس باپلاتفرم 2000Illumina HiSeqتعیین توالی شدند. همردیفی توالیها و تعیین واریانتها صورت گرفت. تغییراتی کهMinimal Allele MAF (Frequency)گزارش شده داشتند و فاقد اثر مشخص بر روی آمینواسیدها یا اسپلایسنگ بودند، حذف شدند. بعد از مراحل فیلترکردن، نهایتا تغییرp.Pro120Serدر ژنNPC2در خانواده با دو بیمار زنده و تغییر p.Asp251Asn در ژن SUCLA2در خانواده دوم باقی ماندند. این ژنها به ترتیب عامل بیماریهایencephalopathy و Niemann Pickباsuccinylcarnitineبالا هستند. بررسی بالینی دقیق این بیماران نیز نشان از ابتلای آنها به این بیماریهای متابولیک/نوروولوژیک داشتدر این بررسی قدرت روش تعیین توالی اگزوم برای تشخیص و شناسایی علت ژنتیکی بیماریها مشخص گردید. در بیماری NiemannPick در صورتیکه تشخیص بیماری در مراحل ابتدایی انجام پذیرد، دارویMiglustatتجویز میگردد.

کلیدواژه ها:

تعیین توالی اگزوم ، Niemann pick ، آنسفالوپاتی ، ، SUCLA2 ، NPC2