آنالیز فیلوژنی و نوترکیبی در ویروسM سیبزمینی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 876

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0603

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

تغییرپذیری و تکامل در جمعیتهای ویروسی از سرعت زیادی برخوردار است. موتاسیون و نوترکیبی از عوامل موثر در ایجاد تنوع درویروسها هستند. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی و بررسی وقوع نوترکیبی در ویروسM سیبزمینی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن کدکننده پروتئین پوششی ویروس همانندسازی و توالییابی و تنوع ژنتیکی، وقوع نوترکیبی و رابطه فیلوژنی جدایهها بررسی شد. میزان تنوع در بین جدایههایPVMدر سطح نوکلئوتیدی بطور متوسط4/31±15/58و در سطح آمینواسیدی3/17±7/79 بود و در آنالیز فیلوژنی جدایههایPVMدر دو گروه واگرا قرار گرفتند. در یازده جدایه ایرانیPVMنیز نوترکیبی شناسایی شد. با توجه به منابع موجوداین اولین گزارش از وقوع نوترکیبی در ویروسPVMاست.

کلیدواژه ها:

ویروسMسیبزمینی ، ژن کدکننده پروتئین پوششی ، تنوع ژنتیکی ، نوترکیبی

نویسندگان

فاطمه طبسی نژاد

دانشجوی دکتری بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

بهروز جعفرپور

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

محمد زکی عقل

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

حمید روحانی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Chare, E, & Holmes, E. (2006). A phylogenetic survey of ...
  • Clark, M. F., & Adams, A. (1977). Characteristics of the ...
  • Desbiez, C., & Lecoq, H. (2008). Evidence for multiple intraspecific ...
  • Drake, J. W., Charlesworth, B., Charlesworth, D., & Crow, J. ...
  • Heath, L, van der Walt, E., Varsani, A., & Martin, ...
  • Nagy, P. D. (2008). Recombination in plant RNA viruses Plant ...
  • Singh, A. K., Mahinghara, B. K., Hallan, V., Ram, R., ...
  • Singh, L., Hallan, _ Martin, D., Ram, R., _ Zaidi, ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., ...
  • Tan, Z., Wada, Y., Chen, J., & Ohshima, K. (2004). ...
  • Xu, H., D'Aubin, J., & Nie, J. (2010). Genomic variability ...
  • Zanardo, L, Silva, F., Bicalho, A., Urquiza, G., Lima, A., ...
  • Zavriev, S., Kanyuka, K., & Levay, K. (1991). The genome ...
  • نمایش کامل مراجع