پیش بینی کامپیوتری و تأئید آزمایشگاهی ژنهای هدف ریزRNAجدید حفاظت شده

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 630

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0597

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

ریز RNAها، مولکولهایRNAکوچک تک رشته ای هستند که بیان ژن را از طریق اتصال بهmRNAهای هدف و مهار ترجمه آنها و یا شروع تخریبشان تنظیم می کنند. تشخیص هدف ریزRNA مهمترین مسئله در بیولوژی آنها محسوب می شود. الگوریتم های کامپیوتری مهمترین ابزار در پیش بینی اهدافmiRNAها هستند. اخیراً در مطالعه پیشینمان، یک ریزRNAجدید مستقر در ژنTrkC انسانی بااستفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی پیش بینی و با تکنیک های آزمایشگاهی تأئید شد. ژنهای هدف اینmiRNAبا نرم افزارDIANA Lab microT پیش بینی شدند. در مطالعه حاضر، دو مورد از ژنهای هدف پیش بینی شدهHBEGF و MDN1 با تکنیکreal-time PCR تأئید شد. طراحی پرایمرهایreal-time PCRبا ابزارIDT oligo analyzer و primer blastانجام شد. به منظور مطالعه تأثیربیش بیان این miRNAبر بیان ژنهای هدف پیش بینی شده، سازه پیش ساز اینmiRNAدر سلولهایHEK293tترانسفکت شد. نتایجreal-time PCR نشان داد که بیان ژن هایHBEGF و MDN1 در سلولهایی که سازهmiRNAرا بیش بیان می کردند در مقایسه با سلولهایی که با وکتورscrambledترانسفکت شده بودند، کاهش یافته است

نویسندگان

سادات دوکانه ای فرد

گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

بهرام محمدسلطانی

گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

فهیمه السادات حسینی عقدایی

گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

سیدجواد مولی

گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران