بررسی بیوانفورماتیکی پروموتر ژنPSY موثر در پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 592

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0189

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

یکی از روشهای مهم مقابله با انواع تنشها استفاده از ژنهای مقاومت است. بیان ژنها ناشی از عناصر تنظیمی موجود در پروموترآنهاست، بنابراین شناسایی پروموتر با عناصر القاءپذیر و پاسخ دهنده در برابر عوامل تنشزا یکی از راهکارهای کارآمد در تولید گیاهان تراریخت مقاوم به تنشهاست. فیتون سنتازهاPSYدرمسیر سنتز کارتنوئیدها فعال هستند و یک آنزیم کلیدی در تنظیم بیوسنتزABAبه شمار میآیند و یکی از ژنهای موثر در پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی هستند. بدین منظور با استفاده از پایگاه دادهPHYTOZOME1500 نوکلئوتید بالادست ناحیه کد کنندهPSYدر آرابیدوپسیس با شماره 001161243-NMبه عنوان پروموتر انتخاب شد. سپس توالی جهت آنالیز عناصر تنطیمی و فعال کننده، توسط سایت بیوانفورماتیکیPlantCAREمورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که پروموتر ژن مذکور شامل عناصر پاسخ به نور، جاسمونیک اسید، آبسیزیک اسید، جیبرلیک اسید، شرایط بی هوازی، ، سالسیلیک اسید، اتیلن، اکسین و ساعت بیولوژیک بودند .حضور این عناصر دخیل در تنش های زیستی و غیرزیستی تأییدی بر نقش ژنPSYدرپاسخ به این گونه تنشها است

کلیدواژه ها:

بررسی پروموتر ، PSY ، تنش های زیستی و غیرزیستی ، بیوانفورماتیک

نویسندگان

طیبه عبداله زاده

دانشجوی کارشناسی ارشد پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه شیراز

زهره حیدریان

استادیار پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه شیراز

علی نیازی

دانشیار پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Busch, M., Seuter, A., Hain, R. (2002)." Functional analysis of ...
  • Dagostino, D., Aversano, M., Chiusano, L, 2005. "A pipeline for ...
  • Han, H., Li, Y., Zhou, S. (2008)." Overexpres sion of ...
  • Lange, B.M., Ghassemian, M. (2003)." Genome organization in Arabidopsis thaliana: ...
  • Li, F., Vallabhaneni, R. and Wurtzel, E.T. (2008). "PSY3, _ ...
  • Nambara, E. and Marion-Poll, A. (2005). "Abscisic acid biosynthesis and ...
  • Schwartz, S.H., Qin, X.Q., Zeevaart, J.A.D. (2003)." Elucidation of the ...
  • Welsch, R., Wust, F., Bar, C., Al-Babili, S. and Beyer, ...
  • Xiong, _ Schumaker, K.S. and Zhu, J.K. (2002). "Cell signaling ...
  • نمایش کامل مراجع