مقایسه ی توالی نوکلئوتیدی جدایه های ویروس موزائیک گوجه فرنگی از سبزیجات خانواده ی بادنجانیان در استان سمنان

ویروس موزائیک گوجهفرنگی، عضو جنس توباموویروس، بیماریهای مهمی در گوجهفرنگی و سایر محصولات خانواده بادنجانیان درسراسر جهان ایجاد مینماید. آلودگی به این ویروس در ایران، تاکنون از روی گیاهان میزبان متعددی گزارش شده است. در این مطالعه، ده جدایهیToMVاز محصولات سبزی خانوادهی بادنجانیان شامل بادنجان و گوجه فرنگی با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ و میوه به دست آمده از مناطق مختلف استان سمنان) مورد استفاده قرار گرفت. ناحیهی حاوی ژن پروتئین پوششیCPاین جدایهها با استف اده از رونوشتبرداری برگردان و واکنش زنجیره ای پلیمرازRT-PCRبه کمک آغازگرهای5’-) ToMVspec5’-ATTTAAGTGGASGGAAAAVCACT-3’) Tob-Uni و 1 (CGGAAGGCCTAAACCAAAAAG-3’ تکثیر گردید. توالی نوکلئوتیدی ژنCP این جدایهها متعاقباً تعیین گردید و با ناحیهی مربوطه در سایر جدایههای موجود در بانک ژن مقایسه شد. توالی ژن CPدر جدایههای ایرانی و غیر ایرانی، به ترتیب 85/8-99/7 درصدو91/6-100درصددر سطح توالی نوکلئوتیدی و آم ینواسیدی با یکدیگرهمسانی داشتند. به کمک برنامههای مختلف ردیابی نوترکیبی، هیچ گونه شواهدی مبنی بر وقوع نوترکیبی بین جدایه های مورد مطالعه یافت نشد. با استفاده از الگوریتم ،(PHYLIP version 3.5) neighbor-joining و (TREEPUZZLE version 5.0) maximum-likelihoodگروهبندی تبارزایی توالیهای نوکلئوتیدی مورد مطالعه، بررسی گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که جدایههای ایرانی ای ن ویروس در دو گروه ژنتیکی قرار میگیرند: دستهیI (clade)و دستهیIIIهمهی جدایههای ویروسی به دست آمده از استان سمنان، در دستهI گروه بندی شدند. در این مطالعه، برای اولین بار رابطهی تبارزایی توالی ژن پروتئین پوششی جدایههایToMVاز استان سمنان گزارش میشود.

کلیدواژه ها:

آنالیز تبارزایی ، CP ، سمنان ، ToMV