تنوع ژنتیکی جمعیت های Ditylenchus dipsaci آلوده کننده سیر ایران بر مبنی توالی ITS-Rdna

نماتد ساقه و پیاز 1936Ditylenchus dipsaci (Kühn, 1875) Filipjevیکی از مخرب ترین نماتدهای پارازیت گیاهی به خصوص درسیر و پیاز می باشد. طی بازدیدهای انجام شده در فصول زراعی سال 1392 از مزارع سیر شهر طارم در استان زنجان نشانه های بیماریشامل کوتولگی، بدشکلی برگها و کاهش اندازه غده مشاهده گردید. نماتدها از خاک و غده های سیر استخراج، تثبیت و به گلیسرینخالص انتقال و بر اساس ویژگی های ریخت شناختی و ریخت سنجی و با استفاده از کلیدهای موجود، گونه جمعیت های اندازه گیری شدهD. dipsaciتشخیص داده شدند. بمنظور تعیین تنوع ژنتیکی جمعیت هاDNAکل مربوط به 3 جمعیت متمایز استخراج و توسط جفت آغازگرهایAB28 ، Dit58Sfor و TW8، Dit58Srevو آزمونPCRطول کامل از توالی های مربوط به مناطق ژنتیکیITS2ITS1-5.8S-باندازه های390و500bpتکثیر و تعیین توالی گردید. مقایسه توالی های فوق با سایر توالی های موجود درncbi با ابزار جستجوگرBlastنشان داد جمعیت های مذکور به بیشترین میزان ( 100 %) با جدایهKC92322از کشور لهستان و کمترین میزان %93 ) با جدایهKC310733از کشور اکراین مشابه می باشند. جهت بررسی تعیین تنوع ژنتیکی توالی های نوکلئوتیدی جمعیت ها توسط نرم افزارClustalWهمردیف شده و سپس تنوع ژنتیکی موجود در بین جمعیت ها توسط نرم افزار 5.05Megaآنالیز گردید. نتایج حاکی از تنوع ژنتیکی بالا در بین جمعیت های D. dipsaciموجود در منطقه می باشد.

کلیدواژه ها:

تنوع ژنتیکی ، Inter transcribe spacer (ITS) ، Ditylenchus dipsaci ، Internal Transcribed Spacer-Rdna