مطالعه دامنهها و جایگاههای فعال پروتئین های موثر در تنش فلزات سنگین در گیاهان و جانوران
محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 556
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBIS04_140
تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393
چکیده مقاله:
به منظور شناسائی و مطالعه دامنهها و جایگاه های فعال پروتئین های موثر در تنش فلزات سنگین در گیاهان و جانوران ،82 داده از پایگاه داده expasy جمعآوری شد با استفاده از سایت pfam دامنههای پروتئینی و با استفاده از سایت npsa جایگاههای فعال پروتئینی شناسائی و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج حاصل از بررسی 31 دامنه پروتئینی نشان داد که پروتئینهای گیاهی و جانوری از لحاظ دامنه پروتئینی با هم تفاوت معن یداری دارن د. در حالیکه درپروتئین های گیاهی دامنه 2metallothio- وجود دارد، پروتئین های جانوری فاقد این دامنه هستند و به جای آن دارای دامنه metallothio م یباشن د. نتایجهمچنین نشان دادند که طیف فعالیت دامنه metallothio-2 بسیار محدود بوده و تنها قادر به ایجاد پیوند با فلز مس میباشد درحالیکه دامن ه metallothio گستره فعالیت بیشتری داشته و قادر به اتصال به فلزات مختلف از قبیل مس، روی و کادمیم میباشد. نتایج حاصل از بررسی 81 جایگاه فعال بین دو گروهگیاهی و جانوری نشان داد که دو جایگاه Amidation و N-glycosylation بیشتر در گیاهان و جایگاهVertebrate metallothioneins signature بیشتردر جانوان دیده میشود. بر اساس نتایج حاصله میتوان گفت اگرچه تمام پروتئینهای مورد بررسی در این تحقیق در تحمل به تنش فلزات سنگین موثرهستند اما تفاوت های مشخصی بین پروتئینهای گیاهی و جانوری وجود دارد که با شناسائی آنها می توان گیاهان برتر برای فعالیتهای گیاهپالائی تولید کرد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا زکیپور
شیراز دانشگاه شیراز دانشکده کشاورزی بخش زراعت و اصلاح نباتات
عباس عالم زاده
دانشگاه شیراز دانشکده کشاورزی بخش زراعت و اصلاح نباتات
نرجس راهپیما سروستانی
دانشگاه شیراز دانشکده کشاورزی بخش زراعت و اصلاح نباتات
اسماعیل ابراهیمی
دانشگاه شیراز دانشکده کشاورزی بخش زراعت و اصلاح نباتات