آنالیز بیوانفورماتیکی ناحیه کنترل در نژادهای گوسفند

از اوایل قرن بیستم جمعیت جهان روندی رو به افزایش داشته و تأمین نیازهای خوراکی به خصوص پروتئین حیوانی در جیره های غذایی خصوصاً درکشورهای در حال توسعه به مشکل پیچیده ای تبدیل شده است.گوسفند به عنوان حیوانی اهلی برای قرن ها نقش مهمی در تامین منابع غذایی مردم ایران برعهده داشته است. نژادهای مختلفی از گوسفند در سراسر جهان زندگی می کنند که هرکدام ویژگی های خاص خود را دارند. توالیD-LOOP ژنوم میتوکندری ابزار مناسبی برای مطالعه تنوع حیوانات می باشد. در این مطالعه توالی نوکلئوتیدیD-LOOP ژنوم میتوکندری متعلق به نژادهای مختلف گوسفند از پایگاه داده بانک ژن بازیابی شد و تنوع ژنتیکی بین نژادها مورد مطالعه قرار گرفت. تنوع نوکلئوتیدی حدود 0.00754در بین نژادها بدست آمدکه با توجه به اندازه معمول تنوع نوکلئوتیدی مربوط به هاپلوتایپ B که حدود 01/0گزارش شده معقول به نظر می رسد و آنالیز توالی نوکلئوتیدی ناحیهD- LOOP ژنوم میتوکندری در نژادهای گوسفند مربوط به هاپلوتیپ B درصد تشابه را بیش از 09 درصد نشان داد. ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری متعلق به دو نژادZS14(china) وDM21(china) تفاوت زیادی با سایر نژادهای متعلق به هاپلوتیپ B نشان داد و این نژادها در درخت فیلوژنتیکی ترسیمی در یک گروه کاملا جدا قرار گرفتند.

کلیدواژه ها:

آنالیز بیوانفورماتیکی ، D-LOOP ، نژادهای گوسفند