تیروزیناز و مدل سازی آن

آنزیم تیروزیناز موجودات زنده را ازعوامل کشنده حفظ می کند.آنزیم تیروزیناز انسانی از دو زیرواحد گلیکوپروتیینی تشکیل شده که هر زیرواحد آن یونمس را داراست. این آنزیم پروتیین بین غشایی است که درملانوزوم که اندامک لیزوزومی است قرار گرفته و در سلول های ملانوسیت پوست و چشم بیان می شود. نقش این آنزیم درتولید رنگدانه ای به نام ملانین است. ملانین،پوست را در برابر نور خورشید محافظت می کند. مراحل ترجمه و تغییرات پس ازترجمه آنزیم در شبکه آندوپلاسمی و گلژی صورت گرفته که این مرحله ها در فولدینگ صحیح آنزیم نقش دارد . بیماری های حاصل از این آنزیم مربوط به نقص فعالیت در آنزیم به علت تغییر در مراحل ساخت آنزیم از جایگاه ژن و مراحل رونویسی و فاکتور های موثر در رونویسی می باشد. در این مطالعه آنزیم تیروزیناز انسانی با تیروزیناز باسیلوس مگاتریوم از نظر ساختار و عملکرد بررسی شده است این آنزیم به دلیل ساختار گلیکوپروتیینی و جایگاه بین غشایی آن تاکنون کریستالوگرافی و تعیین ساختار نشده است .در این پژوهش سعی شده تا با استفاده از نرم افزار Modeller و سایت های علمیUniprot و pdb این آنزیم مدل سازی شود. الگوی انتخابی برای این آنزیم از طریق فهرست blast انجام شد. در اینجا با توجه به بیشترین درصد شباهت آنزیم تیروزیناز انسانی (29%)نسبت به سایر گزینه ها، آنزیم تیروزیناز باسیلوس مگاتریوم انتخاب شد. با توجه به این که این آنزیم از ابتدایی ترین تا تکامل یافته ترین موجودات زنده وجود دارد روابط تکاملی مربوطه بر اساس توالی این آنزیم از طریق نرم افزار (MEGA(version5 و رسم درختچه های فیلوژنیبررسی شد. همچنین برای بررسی شباهت و تفاوت آنزیم الگو(تیروزیناز باسیلوس مگاتریوم)و آنزیم هدف (تیروزیناز انسانی) از نرم افزار pdbviewer استفاده شد .ارزیابی آنزیم مدل سازی شده با محاسبه RMS انجام شد. همچنین با ایجاد جهش در آمینواسید ها ی آنزیم و مدل سازی های انجام شده ، آمینواسید های حفاظت شده این آنزیم نیز تعیین شد.و محاسبه کمترین میزان انرژی سطح مولکول و پیوند هیدروژنی و نمودار راماچاندران و شناسایی موتیفهای آنزیم از طریق نرم افزار صورت گرفت.

کلیدواژه ها:

تیروزیناز ، مدل سازی با نرم افزارmodeller ، نرم افزار RMS ، pdbviewer