آنالیز بیوانفورماتیکی پروتئین کایمریک طراحی شده به عنوان واکسن سهظرفیتی خوراکی علیه عفونت های اسهالی باکتریال

اسهال ناشی از عفونت های میکروبی یکی از موارد شایع ابتلاء و مرگ و میر به خصوص در کشورهای درحال توسعه محسوب میگردد. با وجود آن که واکسیناسیون علیه این عوامل یکی از راه های مناسب در جهت پیشگیری از بیماری و انتشار آن به شمار می رود ،اما هزینه های بالای مربوط به واکسیناسیون،عامل بازدارنده استفاده از برنامه های پیشگیری در کشورهای فقیر می باشد. در این راستا استفاده از واکسن های چند ظرفیتی، راهکاری اساسی در جهت کاهش هزینه های واکسیناسیون است. از دیگر سو استفاده از باکتری های زنده برای انتقال آنتی ژ نهای محافظتی، به واسطه دارا بودن ویژگی های ادجوانتیقوی و امکان استفاده خوراکی، ضمن کاهش بیشتر هزینه های واکسیناسیون، امکان تقویت ایمنی مخاطی را به عنوان اثربخش ترین مسیر محافظتی دربیماری های اسهالی فراهم میآورد.با استفاده از روش های in silico و در نتیجه امکان پیش بینی ساختارهای ملکولی واکسن طراحی شده می توان کاستی های طراحی صورت گرفته را پیش از انجام آزمایشات تجربی هزینه بر، شناسایی و برطرف نمود و در نتیجه هزینه های بالای مرتبط با فرآیندهای آزمون و خطا رابه نحو چشمگیری کاهش داد. در این پژوهش با هدف تولید واکسن سه ظرفیتی علیه سه عامل شیگلا دیسانتری، یرسینیا انتروکولیتیکا و اشریشیا کلیانتروپاتوژنیک O157:H7، به طراحی یک پروتئین کایمریک شامل شاخص های آنتی ژنیک مربوط به هر یک از این ارگانیسم ها و آنالیز بیوانفورماتیکی آن پرداخته شد. با توجه به اینکه هدف نهایی این مطالعه استفاده از باکتری لاکتوباسیلوس به عنوان وکتور واکسن مورد نظر میباشد، در نتیجه ژن مربوط به سازه طراحی شده، از لحاظ کدون های مطلوب این باکتری بهینه سازی شد و سپس ساختار ژن مورد نظر ،mRNA و پروتئین حاصل از آن و همچنین پایداری آنها با ابزارهای بیوانفورماتیک مورد آنالیز قرار گرفت. در نهایت ایمنوژنیسیته پروتئین نوترکیب طراحی شده نیز با رو شهایin silico پیشبینی گردید.بررسی های انجام گرفته حاکی از آن بود که ساختار طراحی شده برای واکسن سه ظرفیتی علیه ارگانی سمهای یادشده، امکان تولید پروتئین مورد نظر باایمنوژنیسیته مطلوب را فراهم خواهد نمود.

کلیدواژه ها:

واکسن چندظرفیتی ، واکسن خوراکی ، پیشبینی ساختار ، پیشبینی پایداری