ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

بررسی پروفایل عناصر تکراری ژنومی تکثیر یافته براساس تکنیک REP-PCR در تمایز گونههای لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی سنتی

سال انتشار: 1391
کد COI مقاله: IBIS04_023
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 750
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله بررسی پروفایل عناصر تکراری ژنومی تکثیر یافته براساس تکنیک REP-PCR در تمایز گونههای لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی سنتی

فرزانه تفویضی - استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد پرند، گروه زیست شناسی، تهران، ایران
مریم تاج ابادی ابراهیمی - استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکزی، گروه زیست شناسی، تهران، ایران

چکیده مقاله:

باکتری های اسید لاکتیک، گرم مثبت، بدون اسپور، اسیدوفیل و کاتالاز منفی هستند که در محیط ها و غذاهای مختلفی از جمله محصولات لبنی سنتی و غذاهای تخمیری حضور دارند. از طرفی به محصولات صنعتی به منظور افزایش بهبود کیفیت و سلامت بخشی اضافه می شوند. استفاده از لاکتوباسیل ها به عنوان پروبیوتیک ها، نیازمند بکارگیری روش های دقیق و قابل اطمینان جهت شناسایی باکتری ها در سطح سوش می باشد، چراکه بکارگیری تکنیک های بیوشیمیایی جهت متمایز نمودن گونه های نزدیک به هم کارآمد نمی باشد، زیرا بسیاری ازخصوصیات پروبیوتیکی وابسته به سوش می باشد. انگشت نگاری DNA براساس توالی های تکراری ژنومی با روش REP-PCR به عنوان یک روش تایپینگ قدرتمند، جهت تعیین روابط فیلوژنیک و تاکسونومی باکتری ها مطرح می باشد. از مزایای این روش می توان به سهولت انجام کار، صرفه جویی در وقت و هزینه اشاره نمود. لازم به ذکر است این روش قادر به متمایز نمودن سوش های بسیار نزدیک به هم در یک گونه می باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی و شناسایی تنوع ژنتیک سوش های لاکتوباسیل های جدا شده از منابع مختلف لبنی سنتی در ایران می باشد. 81 سوش از محصولات لبنی سنتی از قبیل ماست، پنیر، کشک، دوغ و ترخینه جداسازی و خالص سازی شدند. نمونه ها در محیط مایع Man Rogosa and Sharpe (MRS) کشت شدند، سپس در شرایط 8 درصد C02 و ˚C 37 بمدت 42-84 ساعت انکوبه شدند. سوشهای L. Plantaum DSMZ 6648 و L. johnsonii DSMZ 10533 به عنوان سوش های مرجع مورد استفاده قرار گرفتند. DNA ژنومی بر طبق دستورالعمل کیت Molecular Biological System Transfer (MBST) استخراج گردید. انگشت نگاری DNA با پرایمر REP-I جهت ژنوتایپیگ ایزوله ها انجام شد. ضریب تشابه SM و فاصله ژنتیکی Nei's بین سوش های مورد مطالعه، جهت گروهبندی ژنوتیپ هابا روش های UPGMA و NJ ارزیابی شد. پروفایل REP-PCR نشان داد که هجده ایزوله مورد مطالعه الگوی باندینگ متفاوتی ارائه دادند.9محصول PCR قابل رویت بین bp 550- 2500 مشاهده شد. در کل، از 9 باند حاصل شده ،8 باند پلی مرف یک باند مونومرف و ا باند یونیک حاصل شد. باند bp 1000 مشترک در تمام ایزوله ها بود. باند bp 550 فقط در ایزوله c6m3 مشاهده شد. روش های گروهبندی مختلفی بر روی داده های مولکولی (با استفاده از نرم افزار Darwin و NTSYS) انجام گرفت و نتایج مشابهی در پی داشت که با آنالیزPCA نیز تاییدگردید. در دندروگرام حاصله دو کلاستر اصلی ایجاد شد. در تمامی آنالیزها ایزوله c2h1 و k2l3 با bootstrap 97% با هم در یک گروه قرار گرفتند. بنابراین می توان ادعا کرد که روش REP-PCR یک روش کاربردی و بسیار حساس در تمایز ایزوله های مورد مطالعه می باشد. این تحقیق اولین گزارش مبنی بر بکارگیری روش مولکولی REP-PCR در بررسی فیلوژنتیکی باکتری های پروبیوتیک بومی ایران می باشد.

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا IBIS04_023 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/287578/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
تفویضی، فرزانه و تاج ابادی ابراهیمی، مریم،1391،بررسی پروفایل عناصر تکراری ژنومی تکثیر یافته براساس تکنیک REP-PCR در تمایز گونههای لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی سنتی،چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران،تهران،https://civilica.com/doc/287578

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1391، تفویضی، فرزانه؛ مریم تاج ابادی ابراهیمی)
برای بار دوم به بعد: (1391، تفویضی؛ تاج ابادی ابراهیمی)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه آزاد
تعداد مقالات: 1,168
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی