شناسایی ژن ها و عوامل تنظیمی موثر در سرطان معده با استفاده از تحلیل مقایسه ای پروفایل بیان ژن

سابقه و هدف: سرطان معده یکی از علل اصلی مرگ و میر در سراسر جهان است. شناسایی ژن ها و مسیرهای عملکردی دخیل در این سرطان می تواند به بهبود پیش آگاهی و یافتن مسیرهای درمانی مناسب و به موقع کمک کند. هدف از این پژوهش شناسایی مسیرها، ژن های کلیدی و میکرو RNAهای مهم در ارتباط با سرطان معده بود. مواد و روش ها: داده های ترنسکریپتومی افراد سالم و مبتلا به سرطان معده با استفاده از ابزار GEO۲R تجزیه وتحلیل شد. سپس آنالیز مسیر و هستی شناسی ژن های با بیان متفاوت انجام گرفت. ژن های کلیدی با استفاده از افزونه CytoHubba از نرم افزار Cytoscape انتخاب و با استفاده از پایگاه GEPIA تایید شدند. در نهایت، میکروRNAهای مرتبط شناسایی و شبکه برهم کنش ژن هدف–میکروRNA رسم شد. یافته ها: در این مطالعه، ۵۶۰ ژن با بیان افتراقی معنادار بین افراد مبتلا به سرطان معده و افراد سالم شناسایی شدند که از این تعداد، ۳۴۲ ژن افزایش بیان و ۲۱۸ ژن کاهش بیان داشتند. ژن های بیش بیان بیشتر در مسیرها و فرایندهایی مانند «مسیر پیام رسانی گیرنده سلول T»، «سمیت سلولی با واسطه سلول های کشنده طبیعی» و «پاسخ سیستم ایمنی» نقش دارند و ژن های کم بیان بیشتر در فرایندهای «انتقال اسید چرب» و «ورود اسید چرب با زنجیره طویل» دخیل بودند. از بین ۱۰ ژن کلیدی اولیه، ۷ ژن شامل MKI۶۷، CDC۲۰، CDC۶، MYBL۲، DTL، CCNA۲ و CDKN۳ تایید شدند. مهم ترین میکروRNAهای مرتبط نیز شامل miR-۴۵۴-۳p، miR-۱۹a-۳p، miR-۳۰۱-۵p و miR-۱۹b-۳p بودند. استنتاج: این پژوهش نشان می دهد که ژن ها و میکرو RNAهای مشخص شده می توانند به عنوان نشانگرهای تشخیصی و درمانی برای سرطان معده مورد استفاده قرار بگیرند. همچنین، بررسی نحوه عملکرد، هستی شناسی و تجزیه و تحلیل غنی سازی این ژن ها می تواند در تحقیقات آینده برای طراحی مسیرهای درمانی مناسب و در نتیجه کاهش مرگ و میر ناشی از این بیماری مورد توجه قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

immune system ، key genes ، microRNA ، microarray ، gene ontology ، signaling pathways ، سیستم ایمنی ، ژن های کلیدی ، میکرو RNA ، میکرواری ، هستی شناسی ژن ، مسیرهای سیگنال دهی