بررسی روابط پلیوتروپیک ویتلوژنین در شبکه پاسخ به تنش زنبور عسل با استفاده از رویکرد تحلیل شبکه (PPI)
محل انتشار: یافته های نوین علوم دامی، دوره: 1، شماره: 3
سال انتشار: 1405
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 19
فایل این مقاله در 21 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NAIAS-1-3_005
تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1405
چکیده مقاله:
هدف: زنبور عسل (Apis mellifera) به عنوان گرده افشان کلیدی، نقشی حیاتی در حفظ تنوع زیستی و امنیت غذایی دارد اما در دهه های اخیر با چالش های محیطی از جمله تنش های گرمایی و اکسیداتیو مواجه شده است. پاسخ مولکولی زنبور عسل به این تنش ها فرایندی چندلایه است که شبکه های پیچیده ای از پروتئین ها را در بر می گیرد. هدف از این پژوهش، تحلیل شبکه تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) برای شناسایی گره های کلیدی و الگوهای سازمان یابی عملکردی در پاسخ به تنش، با تمرکز بر نقش پلیوتروپیک ویتلوژنین(Vg) بود.روش پژوهش: با استفاده از پایگاه داده STRING، شبکه ای متشکل از ۲۵ ژن کاندید مرتبط با دفاع آنتی اکسیدانی، پاسخ به شوک حرارتی، ایمنی ذاتی و تنظیم متابولیک-هورمونی ساخته و در نرم افزار Cytoscape مصورسازی و تحلیل شد. ماژول های عملکردی شبکه با افزونه MCODE شناسایی و شاخص های مرکزیت (Degree، Betweenness، Closeness و (Eigenvector با افزونه CytoNCA محاسبه شدند. همچنین، تحلیل غنی سازی فرایندهای زیستی و کارکردهای مولکولی Gene Ontology و نیز مسیرهای KEGG و Reactome با استفاده از پایگاه داده STRING انجام گرفت.یافته ها: نتایج نشان داد که این شبکه ساختاری منسجم دارد که در آن ژن های Sod۱، Trx-۲ و Sod۲ با بالاترین درجه اتصال(Degree=۱۶) به عنوان هاب های اصلی شناسایی شدند و نقش محوری در دفاع آنتی اکسیدانی ایفا می کنند. تحلیل مرکزیت شبکه نشان داد که Vg با بالاترین مقدارBetweenness centrality به عنوان مهمترین گره واسط عمل می کند و ماژول های عملکردی مجزا را به یکدیگر پیوند می زند. واکاوی زیرشبکه القاشده درجه اول متمرکز برVg ارتباط مستقیم این پروتئین با ۱۱ همسایه عملکردی در حوزه های دفاع آنتی اکسیدانی، ایمنی ذاتی و مسیرهای متابولیک-هورمونی را آشکار ساخت. تحلیل غنی سازی عملکردی در پایگاه های Gene Ontology، KEGG و Reactome برجستگی فرایندهای مرتبط با پاسخ به تنش اکسیداتیو، تنظیم متابولیسم و ایمنی ذاتی را تایید کرد.نتیجه گیری: این یافته ها نشان می دهند که پاسخ به تنش در زنبور عسل بر تعامل چهار محور اصلی دفاع آنتی اکسیدانی، پاسخ حرارتی، ایمنی و تنظیم متابولیک استوار است و Vg به عنوان هماهنگ کننده میانماژولی این سامانه ها عمل میکند. شناسایی این شبکه یکپارچه و گره های هاب می تواند به معرفی نشانگرهای مولکولی کاندید برای بهبود تحمل تنش و افزایش بقای کلنی های زنبور عسل در برنامه های اصلاح نژادی کمک کند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا رودباری
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایرن.
آزاده ترابی
موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
