آنالیز مقایسه ای خصوصیات ژنوم گیاهان پست و عالی

بررسی منابع نشان می دهد مطالعات جامعی به منظور مقایسه ژنومی بین گیاهان پست و عالی انجام نشده است به خصوص با توجه به این که اطلاعات ژنومی آن ها به روزرسانی می شود. از این رو، در این پژوهش، ژنوم خزه (Physcomitrium patens) به عنوان گیاه پست با ژنوم صنوبر (Populus trichocarpa) به عنوان گیاه عالی مورد مقایسه قرار گرفت. در این پژوهش، اندازه ژنوم، تعداد کروموزوم، محتوای کلی سیتوزین-گوانین (GC)، تعداد کل ژن ها، ژن های رمزکننده پروتئین، RNAs کوچک، ژن های کاذب، عناصر متحرک و ریزماهواره های ژنوم دو گونه مورد پژوهش استخراج شد. نتایج نشان داد اندازه ژنوم خزه بزرگتر و دارای ۲۳۷۴۷ ژن که در میان این ژن ها، ۲۰۴۵۴ ژن رمزکننده پروتئین وجود داشت. اندازه ژنوم صنوبر کوچکتر و دارای ۳۴۶۲۱ ژن که در میان این ژن ها، ۲۹۶۱۷ ژن رمزکننده پروتئین وجود داشت. تعداد RNAs کوچک برای ژنوم خزه و صنوبر به ترتیب ۸۶۳ و ۱۳۴۷ بود. تعداد ژن های کاذب در ژنوم صنوبر ۹/۲ برابر ژنوم خزه بود. برخی از ژن ها فقط در خزه یافت شدند. عناصر متحرک Gypsy در خزه و صنوبر به ترتیب ۹/۴۷ و ۹۳/۱۴ درصد از کل ژنوم را به خود اختصاص داده اند. در مجموع، عناصر متحرک در ژنوم خزه ۶/۱ برابر ژنوم صنوبر بود. تعداد و ترکم ریزماهواره در ژنوم خزه به ترتیب ۶/۱ و ۵/۱ برابر گیاه عالی صنوبر بود. فرآیند تکامل در گیاهان احتمالا سبب کاهش تعداد و تراکم ژن های غیرکارکردی (عناصر متحرک و ریزماهواره ها) و افزایش تعداد ژن های کارکردی شده است. اطلاعات مفید حاصل از این قبیل مطالعات ژنومیکس مقایسه ای میتواند راه را برای اجرای طرح های کاربردی هموارتر نماید.

کلیدواژه ها:

تکامل ، ژنوم ، ریزماهواره ها