ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مقایسه پنج روش استخراج DNA ژنومی در گیاه دارویی گاوزبان ایرانی (Echium amoenum)

محل انتشار: مجله پژوهش های گیاهی، دوره: 36، شماره: 3
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 37

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2754864

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJBIO-36-3_004

تاریخ نمایه سازی: 11 آبان 1405

چکیده مقاله:

در مطالعه تاکسونومی گیاهان دارویی روش های مبتنی بر DNA، جذاب تر از روش های کلاسیک هستند. استخراج DNA از گیاهان دارویی به دلیل متابولیت های ثانویه بیشتر با مشکلاتی مواجه است. در این مطالعه جهت انتخاب یک روش مناسب برای استخراج DNA از برگ های تازه و هرباریومی گیاه گاوزبان ایرانی، پنج دستورکار شامل روش دویل و دویل اصلی، دو روش دویل و دویل تغییریافته (که بدون ۲-مرکاپتواتانول یا استات آمونیوم است)، روش تغییریافته موری و تامسون و کیت Gene All ارزیابی شدند. کیفیت و کمیت DNA با روش های الکتروفورز روی ژل و اسپکتروفتومتری بررسی گردید. قابلیت استفاده DNA خالص سازی شده از طریق PCR توالی فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (ITS) در DNA ریبوزومی هسته ای آزمایش شد. در مقایسه با روش دویل و دویل اصلی، حذف ۲-مرکاپتواتانول یا استات آمونیوم از این روش، تاثیر معناداری (p-value > ۰.۰۵) روی کیفیت و کمیت DNA استخراج شده از گیاه گاوزبان تازه و هرباریومی نداشتند. اگرچه بیشترین غلظت DNA از برگ های هرباریومی با روش موری و تامسون تغییریافته به دست آمد، ناحیه ITS در این نمونه تکثیر نشد. محصولات PCR مورد انتظار از ناحیه ITS در سایر نمونه های DNA تکثیر شدند. درنتیجه، روش دویل و دویل تغییریافته ساده تر با حذف ۲-مرکپتواتانول یا استات آمونیوم برای استخراج DNA از برگ های تازه و خشک گیاه گاوزبان مفید است. این تغییر اثر منفی روی مرحله PCR در ادامه کار ندارد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زهرا علیدوستی شهرکی

گروه سلولی و مولکولی، دانشکده زیست شناسی ، دانشگاه دامغان، دامغان، ایران

پریسا فرخ

گروه سلولی و مولکولی، دانشکده زیست شناسی، دانشگاه دامغان، دامغان، ایران

عاطفه امیراحمدی

گروه علوم گیاهی. دانشکده زیست شناسی. دانشگاه دامغان. دامغان.ایران

آرزو رضایی

گروه سلولی و مولکولی، دانشکده زیست شناسی، دانشگاه دامغان، دامغان، ایران

جواد قاسمیان

دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر، دانشگاه دامغان، دامغان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • حسین پور آزاد، ن.، نعمت زاده، ق.، ۱۳۹۱، معرفی روش ...
  • طغیانی، م. ا.، احسان پور، ع. ا.، شریعتی، م.، امام ...
  • نادری حاجی باقرکندی، م.، باقر رضایی، م.، ۱۳۸۳، بررسی فیتوشیمیایی ...
  • نصیری، س.، یوسفی، م.، حائری نسب، م.، ۱۴۰۰، بررسی تنوع ...
  • نقدی بادی، ح.، سروش زاده، ع.، رضازاده، ش.، شریفی، م.، ...
  • Abdullah, F. I., Chua, L. S., Rahmat, Z., Samad, A. ...
  • Aboul-Maaty, N. A. F., and Oraby, H. A. S., ۲۰۱۹. ...
  • Abu-Romman, S., ۲۰۱۱. Comparison of methods for isolating high quality ...
  • Arruda, S. R., Pereira, D. G., Silva-Castro, M. M., Brito, ...
  • Biswas, N., and Verma, S. K., ۲۰۲۰. A novel nucleic ...
  • Demeke, T., and Jenkins, G. R., ۲۰۱۰. Influence of DNA ...
  • Doyle, J. J., and Doyle, J. L., ۱۹۸۷. A rapid ...
  • Drábková, L. Z., ۲۰۱۴. DNA Extraction from Herbarium Specimens. Methods ...
  • Friar, E. A., ۲۰۰۵. Isolation of DNA from Plants with ...
  • Ghadia, B., Singh, A. K., Khatnani, T., Hirpara, M., Patel, ...
  • Heikrujam, J., Kishor, R., and Mazumder, P. B., ۲۰۲۰. The ...
  • Hosseinpour Azad, N., and Nematadeh, G. H., ۲۰۱۳. Introducing a ...
  • Hu, Y., Xie, X., Wang, L., Yang, J., Zhang, H., ...
  • Li, H., Li, J., Cong, X. H., Duan, Y. B., ...
  • Manoko, M. L. K., ۲۰۱۸. The power of coefficients and ...
  • Mogg, R. J., and Bond, J. M., ۲۰۰۳. A cheap, ...
  • Murray, M. G., and Thompson, W. F., ۱۹۸۰. Rapid isolation ...
  • Nadi, F., ۲۰۱۷. Bioactive compound retention in Echium amoenum Fisch. ...
  • Palhares, R. M. P., Drummond, M. G., Brasil, B. S. ...
  • Pires, A. C., and Marinoni, L., ۲۰۱۰. DNA barcoding and ...
  • Pookhamsak, P., Pornbungkerd, P., and tantasawat, P. A., ۲۰۱۹. Simple, ...
  • Reiss, R. A., and Rutz, B., ۱۹۹۹, Quality control PCR: ...
  • Riahi, M., Zarre, S., Maassoumi, A. A., Attar, F., and ...
  • Sang, T., Crawford, D. J., and Stuessy, T., ۱۹۹۵. Documentation ...
  • Sari, V. K., and Murti, R. H., ۲۰۱۵. An Effective ...
  • Sarrazola, H. J., and Alzate, F. A., ۲۰۱۹. Obtaining DNA ...
  • Schmiderer, C., Lukas, B., and Novak, J., ۲۰۱۳. Effect of ...
  • Schrader, C., Schielke, A., Ellerbroek, L., and Johne, R., ۲۰۱۲. ...
  • Sharma, P., Joshi, N., and Sharma, A., ۲۰۱۰. Isolation of ...
  • Sumitha, V. R., Gangaprasad, A., and Nair, G. M., ۲۰۱۵. ...
  • Susilowati, A., Rachmat, H. H., Rangkuti, A. B., Elfiati, D., ...
  • Vural, H. C., ۲۰۰۹. Genomic DNA isolation from aromatic and ...
  • White, T. J., Bruns, T., and Taylor, J., ۱۹۹۰. Amplification ...
    • نمایش کامل مراجع