معرفی و ارزیابی بیوانفورماتیکی یک سازه ایمنوژن و موثر متشکل از اپی توپ های آنتی ژن های L۷/L۱۲، BLS، bp۲۶ به منظور طراحی واکسن نوترکیب برعلیه بیماری بروسلوز
محل انتشار: بهداشت و بیماری های عفونی دام، دوره: 1، شماره: 1
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 16
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AHID-1-1_007
تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1405
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: باکتری بروسلا یک پاتوژن درون سلولی اجباری است که عامل بیماری تب مالت در انسان و دام است و به شدت هم مسری می باشد. در ساخت واکسن رایج موجود برای مقابله با این پاتوژن معمولا از کل پیکره باکتری مولد این بیماری استفاده می شود، به همین دلیل استفاده از آن عوارض بسیار زیادی دارد. امروزه استفاده از واکسن های زیر واحدی با هدف حذف بخش های پاتوژنیک و تقویت بخش های ایمنوژنیک بسیار مورد توجه قرار گرفته است. مواد و روش ها: در این مطالعه از اپی توپ های سه آنتی ژن L۷/L۱۲، BLS و bp۲۶ از باکتری بروسلا برای طراحی سازه نوترکیب ایمنوژنیک استفاده شده است. بدین منظور برای پیش بینی اپی توپ های هریک از سه آنتی ژن مذکور از سرروهای معتبر و آنلاین IEDB و IFNepitope استفاده شد. در ادامه پس از شناسایی قویترین اپی توپ های این آنتی ژن ها، مهندسی سازه با استفاده از اپی توپ ها، لینکرهای پپتیدی و ادجوانت مولکولی HBHA انجام شد. ارزیابی خواص فیزیکو شیمایی، ساختار دوم، ساختار سوم، میزان آنتی ژنیسیتی و آلرژنیسیتی توالی پروتئینی سازه مذکور به ترتیب توسط سرورهای ProtParam، SOPMA، I-TASSER، VaxiJen و AllerTOP انجام شد. در نهایت پس از ریفاین کردن و انجام آنالیزهای راماچاندران مربوط به ساختار سوم سازه طراحی شده به ترتیب توسط سرورهای GalaxyRefine و VADAR، فرایند برهمکنش پروتئین-پروتئین بین مولکول HBHA حاضر در سازه نوترکیب و گیرنده TLR۴/MD-۲ نیز توسط سرور آنلاین ClusPro بررسی شد. یافته ها: بر اساس نتایج بدست آمده سازه نوترکیب در دو دمین ادجوانتی (N ترمینال) و اپی توپی (C ترمینال) با استفاده از لینکر غیر منعطف EAAAK با موفقیت طراحی شد. سایر ارزیابی ها نشان داد این سازه نوترکیب دارای وزن مولکولی ۱۳ /۳۶۲۵۶ دالتون و نقطه ایزوالکتریک ۳۷/۸ است همچنین شاخص آلیفاتیک آن برابر با ۱۰/۷۷ و شاخص GRAVY آن برابر ۶۱۳/۰- می باشد. از طرفی بر اساس شاخص ناپایداری ارائه شده این پروتئین را در دسته پروتئین های پایدار طبقه بندی می کند. بر اساس بررسی های بیشتر، این ساختار یک سازه غیر آلرژن با امتیاز آنتی ژنیسیتی ۸۲۸۷//۰ گزارش شد. نتایج داکینگ پروتئین-پروتئین نشان داد که همکنش بین مولکول HBHA و گیرنده TLR۴/MD-۲با ۶۲ عضو خوشه و کمترین انرژی اتصال ( ۸/۸۵۸- کیلوکالری بر مول ) با موفقیت انجام خواهد شد.نتیجه گیری: بنابراین بر اساس نتایج ارائه شده می توان سازه نوترکیب برپایه اپی توپ را به عنوان یک سازه موفق برای ساخت واکسن های زیر واحدی معرفی کرد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
نرگس نظیفی
گروه علوم پایه، دانشکداه دامپزشکی، دانشگاه لرستان، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
