فراتحلیل پویش کل ژنوم برای شناسایی شبکه های ژنی مرتبط با ماربلینگ در گاوهای گوشتی

ماربلینگ یا رگه های چربی درون ماهیچه ای، یکی از شاخص های کلیدی کیفیت گوشت گاو است که بر طعم، آب داری و نرمی آن اثر مستقیم دارد و نقش مهمی در ارزش اقتصادی و بازارپسندی محصول ایفا می کند. این مطالعه فراتحلیلی (متاآنالیزی) با هدف شناسایی شبکه های ژنی و نواحی ژنومی مرتبط با ماربلینگ در گاوهای گوشتی انجام شد. با استفاده از داده های پویش کل ژنوم (GWAS) و تحلیل شبکه هم بیانی ژن ها، نواحی ژنومی و ژن های کاندید موثر بر این صفت بررسی شدند. داده ها از پایگاه های علمی معتبر جمع آوری و استانداردسازی شدند و با روش های آماری فیشر و استوفر تحلیل شدند تا قدرت آماری افزایش یابد. نتایج نشان داد که کروموزوم ۱۵، با ژن CADM۱ و بالاترین سطح معنی داری (۲۴/۲۹log۱۰(p) =-)، نقش اصلی را در تنظیم ماربلینگ ایفا می کند. کروموزوم های ۱، ۲، ۱۲، ۱۷، ۱۹ و ۲۴ نیز به عنوان نواحی کلیدی شناسایی شدند که شامل ژن های مرتبط با متابولیسم لیپید و سیستم ایمنی هستند. تحلیل شبکه هم بیانی ژن ها، دو ژن محوری CLEC۱۲A و CD۶۹ را در کروموزوم ۵ شناسایی کرد که در تنظیم مسیرهای بیولوژیکی شامل متابولیسم چربی، تنظیم ایمنی، سیگنال دهی سلولی و کنترل رونویسی نقش دارند. این شبکه با ساختار بدون مقیاس، پایداری و انعطاف پذیری بیولوژیکی را نشان داد. یافته های این مطالعه امکان توسعه نشانگرهای مولکولی برای انتخاب ژنومی هدفمند را فراهم می آورند که می تواند کیفیت گوشت را بهبود بخشیده و رقابت پذیری صنعت گوشت را در بازارهای جهانی افزایش دهد. مطالعات آینده با استفاده از داده های توالی یابی کل ژنوم و تحلیل های چند-اومیکس می توانند این نتایج را تکمیل کنند.

کلیدواژه ها:

پویش کل ژنوم (GWAS) ، شبکه های ژنی ، فراتحلیل ، گاو گوشتی ، ماربلینگ