تحلیل بیوانفورماتیکی مقایسه ژنوم دو گونه مایکوپلاسما آگالاکتیه و مایکوپلاسما بوویس در همولوژی ژن vspA

ژن vspA به عنوان یکی از اعضای اصلی خانواده ی پروتئین های سطحی متغیر (Vsp family) در گونه های مختلف مایکوپلاسما شناخته می شود و نقش مهمی در فرار از پاسخ ایمنی میزبان، چسبندگی به سلول های هدف و سازگاری با محیط های متفاوت دارد. در این پژوهش، به منظور بررسی میزان همولوژی و مشابهت ژن vspA میان دو گونه ی بیماری زای مایکوپلاسما بوویس و مایکوپلاسما آگالاکتیه، از رویکردهای بیوانفورماتیکی مبتنی بر پایگاه NCBI استفاده شد. توالی آمینواسیدی ژن vspA از مایکوپلاسما بوویس به عنوان توالی مرجع انتخاب و توسط ابزار BLASTp با ژنوم مایکوپلاسما آگالاکتیه مقایسه گردید. نتایج نشان داد چندین پروتئین سطحی از مایکوپلاسما آگالاکتیه با درصد هویت بین ۶۵ تا ۷۷ درصد و پوشش توالی ۱۳ تا ۱۷ درصد با ژن مرجع شباهت دارند. تحلیل هم ترازسازی چندتایی و دامنه های محافظت شده نشان داد که ناحیه ی N-terminal پروتئین ساختاری محافظت شده و مشترک دارد، در حالی که نواحی متغیر احتمالا در تعاملات آنتی ژنی و تغییرات سطحی دخیل اند. این یافته ها بیانگر منشا تکاملی مشترک میان دو گونه و وجود ژن های شبه-vspA در مایکوپلاسما آگالاکتیه است. بررسی بیشتر این ژن می تواند در درک مکانیسم های بیماری زایی، طراحی واکسن های هدفمند و توسعه ی کیت های تشخیصی اختصاصی برای گونه های مختلف مایکوپلاسما موثر واقع شود.

کلیدواژه ها:

مایکوپلاسما آگالاکتیه ، مایکوپلاسما بوویس ، ژن vspA ، بیوانفورماتیک ، پروتئین سطحی متغیر