مقایسه اثرهای مولکولی آبامکتین و ایورمکتین در تغییرهای ساختاری پروتئین آلبومین سرم گاوی با استفاده از روش های طیف سنجی و داکینگ مولکولی
سال انتشار: 1404
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 71
فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-15-60_007
تاریخ نمایه سازی: 17 اسفند 1404
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: آفت کش ها از مهم ترین عوامل محیطی هستند که در سالیان اخیر به طور گسترده تولید و استفاده می شوند و اثرهای انکارناپذیری بر محیط زیست و سلامت انسان بر جای می گذارند. آورمکتین ها آفت کش های جدیدی هستند که نمونه هایی از آن شامل آفت کش آبامکتین و داروی ضدانگل ایورمکتین می باشد. در تحقیق حاضر اثرهای مولکولی برهم کنش آبامکتین و ایورمکتین بر تغییرهای ساختاری پروتئین سرم گاوی به طور مقایسه ای موردبررسی قرار می گیرد.
مواد و روش ها: در این پژوهش، اثر برهم کنش آلبومین سرم گاوی (BSA) با دو ترکیب آبامکتین (آفت کش) و ایورمکتین (داروهای ضدانگل) با روش های مختلف طیف سنجی مرئی- فرابنفش، فلورسانس ذاتی در غلظت های مختلف اوره و طیف سنجی تبدیل فوریه فروسرخ (ATR-FTIR) همراه با مدل سازی مولکولی و مطالعه های تجمع گرمایی موردبررسی قرار گرفت.
یافته ها: نتایج طیف سنجی مرئی-فرابنفش نشان داد که افزایش غلظت لیگاندها (آبامکتین و ایورمکتین) باعث کاهش شدت جذب در طول موج ۲۸۰ نانومتر (اثر هیپوکرومیک) شده است که نشان دهنده تشکیل کمپلکس بین لیگاندها با BSAمی باشد. بررسی تغییرهای انرژی آزاد اتصال (ΔG) تایید کرد که این برهم کنش ها خودبه خودی هستند. بررسی اثر اوره با روش طیف سنجی فلورسانس نیز نشان دادند که شدت نشر پروتئین در حضور آبامکتین نسبت به ایورمکتین کاهش بیشتری داشت که نشان دهنده تغییر قطبیت محیط اطراف باقی مانده های اسیدآمینه های آروماتیک مانند تریپتوفان است. همچنین نتایج طیف سنجی تبدیل فوریه فروسرخ (ATR-FTIR) نشان داد که محتوای ساختار دوم پروتئین BSA در حضور لیگاندها تغییرهای جزیی دارد. نتایج حاصل از تحلیل داکینگ مولکولی نشان داد که آبامکتین اتصال پایدارتری به پروتئین دارد، زیرا مقدار انرژی اتصال آن (۹/۱۱-کیلوکالری بر مول) کمتر از ایورمکتین (۰/۱۱-کیلوکالری بر مول) است. نتایج تجمع پروتئین نشان داد که BSA تمایل بالایی به تجمع در حضور هر دو لیگاند دارد. مقایسه اثرهای مولکولی این دو لیگاند نشان دادند که تغییرهای ساختاری پروتئین در برهم کنش با آبامکتین نسبت به ایورمکتین بیشتر است که می تواند به دلیل تفاوت در نوع گروه های عاملی و ساختار شیمیایی لیگاندها باشد.
نتیجه گیری: این مطالعه با استفاده از تکنیک های طیف سنجی و مدل سازی مولکولی نشان دادند که اثرهای مولکولی آبامکتین نسبت به ایورمکتین در تغییر ساختار BSA بیشتر است به دلیل تفاوت نوع برهم کنش و تفاوت در ساختار شیمیایی و نوع گروه های عاملی در این لیگاندها می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
اسما ولی زاده
Department of Biology, SR.C., Islamic Azad University, Tehran, Iran
پروانه مقامی
Department of Biology, SR.C., Islamic Azad University, Tehran, Iran.
لیلا حسنی
Department of Biological Sciences, Institute for Advanced Studies in Basic Sciences (IASBS), Zanjan ۴۵۱۳۷-۶۶۷۳۱, Iran
سهراب ایمانی
Department of Entomology, SR.C., Islamic Azad University, Tehran, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :