مطالعات QSAR ، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی بازدارنده های فلاپ برای بیماری شریان کرونری

هدف: فعال کننده پروتینی ۵-لیپوکسی ژناز(فلاپ) در سنتز لیوکوترین لازمند و میانجی های چربی هستند. در این مطالعه محاسبات فعالیت-ساختار روی ۳۰ ترکیب انجام شده است.مطالعات داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام شده و دو ترکیب دارویی جدید پیشنهاد شده است.

مواد و روش ها: ساختار ۳۰ ترکیب با استفاده از برنامه کم درا رسم شده است.داده های تجربی مورد نیاز از منابع موجود استخراج شده است.ساختار لیگاند با استفاده از برنامه ماروین اسکچ رسم شده و مطالعات داکینگ با استفاده از برنامه وینا برای ارزیابی برهم کنش ها انجام شده است.در این مطالعه از برنامه کورال سی برای به مدل در آوردن فعالیت ۳۰ ترکیب بازدارنده های فلاپ استفاده شده است. در محاسبات داکینگ مولکولی برهم کنش های بین سیستم پروتینی با PDB: ۱B۴۳ و مولکول های بهینه شده ارزیابی شدند. . محاسبات شبیه سازی دینامیک مولکولی روی مولکول ۹ انجام شد.

نتایج: در محاسبات مونته کارلو برای سری تست و آموزش این نتایج بدست آمدند: ۱۰ n = , ۹۹۸۶/، , R&sup۲;=۹۹۷۵/۰Q&sup۲;= (برای سری آموزش( و ۱۰ , n = ۹۹۹۹۷/۰, R&sup۲;= ۹۹۹۵/۰Q&sup۲;= (برای سری تست). در مطالعات داکینک حداکثر افینیتی ۹/۱۰-کیلو کالری بر مول بود که نشان دهنده برهم کنش قوی است.

نتیجه گیری:. مولکول های ۹ و ۱۵ بعنوان ترکیبات پایدار برای مطالعات بیشتر بالینی پیشنهاد می شوند.

کلیدواژه ها:

Migraine