بررسی نقش lncRNAهای مرتبط با سلول های T در عود گلیوبلاستوما با استفاده از تحلیل توالی یابی RNA تک سلولی

مقاله پژوهشیمقدمه: گلیوبلاستوما (Glioblastoma) GBM، یکی از تومورهای بدخیم اولیه سیستم عصبی مرکزی است. محدودیت های جراحی و مقاومت به درمان، از چالش های مهم درمان آن محسوب می شوند. گلیوبلاستوما، به دلیل ناهمگنی ژنتیکی، حضور سلول های بنیادی سرطانی (Cancer stem cells) CSC و ریزمحیط توموری منحصر به فرد (Tumor microenvironment) TME نرخ عود بالایی دارد. تغییرات ژنومی و بیان ژنی که در تومور عودیافته رخ می دهد، با تومور اولیه متفاوت است. هدف این مطالعه، شناسایی lncRNAهای مرتبط با سلول های دخیل در عود و بررسی نقش آن ها در تنظیم پاسخ ایمنی و مکانیسم های مربوطه با استفاده از تحلیل بیوانفورماتیکی داده های RNA تک سلولی بود.روش ها: در این مطالعه با آنالیز اطلاعات توالی یابی RNA تک سلولی (cell RNA sequencing seq) single scRNA، تفاوت های بیان lncRNAها در گونه های مختلف سلولی (Cell Type) گلیوبلاستومای اولیه و عودیافته بررسی شد. تحلیل داده ها با استفاده از پکیج SingleR انجام گردید. سلول های متفاوت، بر اساس الگوی بیان ژنی به چهار نوع مختلف دسته بندی شدند که سلول های T به دلیل نقش کلیدی شان در ریز محیط توموری و ایمنی جهت مطالعه انتخاب شدند.یافته ها: نتایج نشان داد که یازده lncRNA از جمله LINC۰۱۰۸۸، PVT۱ و KCNQ۱OT۱ در سلول های T بین گلیوبلاستومای اولیه و عود یافته تفاوت بیان معنادار دارند.نتیجه گیری: این مطالعه بینش های جدیدی در زمینه ی تفاوت های بیان ژنی بین گلیوبلاستومای اولیه و عودیافته و نقش lncRNAها به عنوان اهداف درمانی بالقوه ارائه می دهد. همچنین احتمالا این lncRNAها می توانند از طریق تنظیم بیان ژن های و مسیرهای مرتبط با سرطان، در شکل گیری و عود مجدد گلیوبلاستوما نقش داشته باشند. نتیجه گیری دقیق و نهایی نیازمند مطالعات تکمیلی است.

کلیدواژه ها:

گلیوبلاستوما ، RNA ، lncRNA ، تک سلولی ، لنفوسیت های T ، ریزمحیط تومور (TME)