شناسایی جایگاه های ژنومی مرتبط با صفت رسیدگی جنسی ماهی قزل آلای رنگین کمان (Oncorhyncus mykiss) با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی

مقدمه: روش تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی مناطق ژنومی در مطالعات نقشه ­یابی صفات کمی از اهمیت زیادی برخوردار می­ باشد. این مطالعه با هدف شناسایی جایگاه ­های ژنومی مرتبط با صفت رسیدگی جنسی ماهی قزل ­آلای رنگین­ کمان به ­روش فراتحلیل داده ­ها انجام شد. مواد و روش ها: بدین منظور اطلاعات ژنوم ماهی قزل ­آلای رنگین­ کمان برای شناسایی جایگاه­ های صفات کمی در بانک پایگاه­ های اطلاعاتی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس اطلاعات مربوط به نرم­ افزارهای آماری مورد استفاده در نقشه ­یابی ارتباطی ارائه و پس از آن فرصت­ ها و چالش ­های نقشه ­یابی ارتباطی و مطالعات پسا نقشه ­یابی در سطح کل ژنوم مورد بحث قرار گرفتند. برای نقشه ­یابی جایگاه­ های صفات کمی مرتبط با یک نشانگر مولکولی، توالی نوکلئوتیدی آن نشانگر و برای نقشه ­یابی جایگاه­ های صفات کمی مرتبط با دو نشانگر مولکولی مجاور، توالی نوکلئوتیدی هر دو نشانگر مجاور یکدیگر از پایگاه ­های اطلاعاتی مربوطه استخراج شد. مکان ­یابی هر جایگاه صفت کمی براساس نقشه ژنتیکی و در سطح اطمینان ۹۵ % انجام و از نرم­افزار Bio Mercator برای پیش ­بینی مکان و سطح اطمینان MQTL براساس روش حداکثر احتمال استفاده شد. نتایج: در مجموع تعداد ۱۱ MQTL ارتباط معنی ­داری را نشان دادند و بیش ترین تعداد جایگاه­ های صفات کمی شناسایی شده در گروه پیوستگی ۶، ۸، ۱۲ و ۱۳ قرار داشتند. بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان داد که جایگاه ­های صفات کمی هم مکان برای صفت مورد مطالعه وجود دارند که می ­توانند در به ­نژادی و مهندسی ژنتیک ماهی قزل ­آلای رنگین ­کمان به کار روند.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، ژنوم ، رسیدگی جنسی ، قزل آلای رنگین کمان ، QTL