ارزیابی بیوانفورماتیکی و داکینگ مولکولی ترکیبات زیست فعال گیاه Salvia hydrangea علیه اهداف کلیدی در آفت Phthorimaea operculella

گیاه Salvia hydrangea به بودن ترکیبات زیست فعال متنوع به عنوان منبع بالقوه ای برای توسعه آفت کشهای گیاه پایه مورد توجه قرار گرفته است. در این پژوهش چهار ترکیب اصلی شامل ۱،۸-سینئول (۸' ۱- Ursolic) بر اساس داده های پایگاه های KEGG Compound ChEBI PubChem و PlantCye انتخاب شدند پیش بینی اهداف زیستی با استفاده از SwissTargetPrediction انجام شد و آنزیمهای استیل کولین استراز (AChE) و سیتوکروم (P۴۵۰ CYP۴۵۰ به عنوان اهداف کلیدی شناسایی گردیدند با توجه به فقدان دادههای ساختاری از این آنزیمها در Phthorimaea operculella، مدل سازی همولوژی بر اساس توالی های استخراج شده از گونه Spodoptera frugiperda توسط SWISS-MODEL انجام گرفت داکینگ مولکولی با نرم افزار PyRx و موتور AutoDock Vina نشان داد که اسپاتولنول و اسید اورسولیک بیشترین تمایل اتصال را به (ACE -۵. kcalmol،دارند در حالی که سینئول و کامفور بیشترین تمایل را به (CYP۴۵۰ (-۵.۲ kcal/mol نشان دادند تحلیل مسیرهای زیستی در KEGG تایید کرد که مهار AChE باعث اختلال در انتقال عصبی و مهار CYP۴۵۰ موجب کاهش توانایی سم زدایی در آفت. می شود. Cineole) کامفور (Camphor) اسپاتولنول (Spathulenol) و اسید اور سولیک ه هدف این پژوهش، شناسایی و ارزیابی برهم کنشهای مولکولی ترکیبات زیست فعال منتخب Salvia hydrangea با آنزیمهای کلیدی (acetylcholinesterase (ACE و (cytochrome P۴۵۰ (CYP۴۵۰ در آفت Phthorimaea operculella با استفاده از رویکردهای بیوانفورماتیکی و داکینگ مولکولی است.

کلیدواژه ها:

استیل کولین استراز (ACE) ، بیوانفورماتیک ، گیاهی ، داکینگ ، مولکولی ، سیتوکروم P۴۵۰ ، کنترل زیستی آفات