مطالعه درون رایانه ای فاکتورهای رونویسی موثر بر تنظیم رونویسی ژن کلیدی استیل کو آ کربوکسیلاز دخیل در بیوسنتز متابولیتهای ثانویه در فاطمه امیدی سانجود، لیلا زرندی میاندوآب Dunaliella salina

استیل کوآنزیم آ (Acetyl-CoA) یکی از مولکولهای مرکزی در متابولیسم سلولی و پیش ساز کلیدی در سنتز متابولیتهای ثانویه محسوب می شود. آنزیم استیل کوآ کربوکسیلاز (ACC) با تبدیل Acetyl-CoA به Malonyl-CoA نخستین گام در مسیر بیوسنتز اسیدهای چرب و سایر ترکیبات ثانویه را کنترل می کند و به عنوان نقطه تنظیمی مهم در این مسیر شناخته می شود. با توجه به اهمیت تنظیم بیان ژن ACC در تولید ترکیبات زیستی ارزشمند، هدف این پژوهش شناسایی فاکتورهای رونویسی موثر بر تنظیم این ژن در ریز جلبک Dualiella salina بود. به منظور دستیابی به این هدف، ابتدا توالی ژن ACC و ناحیه پروموتر آن استخراج شد. سپس با استفاده از نرم افزار MEME Suite، و موتیف های تنظیمی احتمالی در ناحیه پروموتر شناسایی گردید. این موتیف ها با پایگاه های داده JASPAR PlantTFDB مقایسه شدند تا فاکتورهای رونویسی احتمالی تعیین شوند. نتایج حاصل نشان داد که خانواده های فاکتورهای رونویسی MYB و bZIP نقش مهمی در تنظیم ژن ACC دارند و احتمالا در پاسخ به تنش های محیطی مانند، خشکی، دمای بالا، سرما و استرس اکسیداتیو دخیل هستند. این یافته ها پایه ای برای راهبردهای مهندسی متابولیک در جهت افزایش تولید متابولیتهای ثانویه در D. salina فراهم می سازد و لزوم انجام مطالعات تجربی بیشتر برای تایید این نتایج را نشان می دهد.

کلیدواژه ها:

استیل ، کوآ ، بیوانفورماتیک ، Acetyl-CoA carboxylase ، Dunaliella salina ، فاکتور رونویسی