بررسی تاریخ دموگرافیک جمعیت‌های Rutilus rutilus در دریاچه‌های شمال اروپا براساس ژن ATP-سنتتاز mtDNA

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 651

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ESPME03_637

تاریخ نمایه سازی: 25 اسفند 1392

چکیده مقاله:

آنالیز نمونه‌های DNA ابزاری قدرتمند در بازسازی تاریخ دموگرافیک جمعیت‌ها می‌باشد. بمنظور شناسایی تاریخ دموگرافیک جمعیت‌های Rutilus rutilus در دریاچه‌های شمال اروپا، توالی‌های ژن ATP-سنتتاز هشت جمعیت Rutilus rutilus از طریق GenBank و داده‌های منتشر شده در مطالعات پیشین بدست آمد و برای آنالیز استفاده شد. بمنظور شناسایی هرگونه انحراف از فرضیه صفر تکامل خنثی، تست‌های Neutrality شامل Tajima's D و Fu's Fs محاسبه شد. تاریخ دموگرافیک جمعیت‌های مورد مطالعه بوسیله آنالیز Mismatch Distribution میان هاپلوتایپ‌‌ها (MMD) استنتاج شد. سازگاری با مدل گسترش ناگهانی جمعیت از معنی‌داری SSD و شاخص Raggedness با 10000 جایگشت ارزیابی شد. بعلاوه، از مقادیرPairwise محاسبه شده برای رسم درخت NJ جمعیتی استفاده شد. نتایج نشان داد که جمعیت‌های Allgjuttern ، Nässjön و Tinnsjön بطور معنی‌دار دچار گسترش اخیر شده‌اند. این گسترش اخیر ممکن است به دلیل افزایش و معرفی مواد غذایی بیشتر به دریاچه‌ها باشد. در این حالت انتظار می‌رود که رقابت سبب کاهش تنوع و حذف گونه‌ها از این اکوسیستم‌ها و بنابراین تنوع گونه‌ای پایین شده باشد. دوم، گسترش اخیر ممکن است به دلیل افزایش اندازه موثر جمعیت با دخالت انسان باشد، چنانچه شواهد نشان می‌دهد که چندین بار به دریاچه‌های Nässjön و Tinnsjön معرفی صورت گرفته است. نتایج نشان داد که همبستگی مثبت معنی‌داری بین فاصله جغرافیایی و فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌ها وجود دارد. آنالیز درخت NJ، مقادیر Pairwise و همچنین آنالیز NM-MDS نشان داد که تمام جمعیت‌ها بجز جمعیت‌های Bysjön و Surtesjön در یک کلاد قرار گرفته ، درحالیکه جمعیت Surtesjön بیشترین تمایز را با این جمعیت‌ها نشان می‌دهد.

نویسندگان

فتاح زارعی

دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم زیستی گروه زیست شناسی جانوری

فاطمه رزمجو

دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم زیستی گروه زیست شناسی جانوری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Baensch, H.A., et al., Aquarien Atlas: Seltene Fische und Pflanzen1991: ...
  • Balkuviene, G. and B. Pernaraviciite, Growth rates of roach (Rutilus ...
  • Froese, R. and D. Pauly, World wide web electronic publication. ...
  • Kottelat, M. and J. Freyhof, Handbook of European freshwater fishes. ...
  • Pinder, A.C., Keys larval and juvenile stages of coarse fishes ...
  • Tarvainen, M., J. Sarvala, and H. Helminen, The role of ...
  • Winfield, I.J., J.M. Fletcher, and J.B. James, The Arctic charr ...
  • . Cragg-Hine, D. Coarse fish and fishery management in Northern ...
  • . Winfield, I.J., D.K. Winfield, and C.M. Tobin, Interactions between ...
  • . Winfield, I., C. Tobin, and C. Montgomery, The fish ...
  • . Horppila, J. and H. Peltonen, The fate of a ...
  • . Minchin, D., C. Maguire, and R. Rosel. The zebra ...
  • . Loot, G., et al., Behaviour of roach (Rutilus rutilus ...
  • . Drummond, A.J., et al., Bayesian coalescent inference of past ...
  • . Campos, P.F., et al., Ancient DNA analyses exclude humans ...
  • . Finlay, E.K., et al., Bayesian inference of population expansions ...
  • . Atkinson, Q.D., R.D. Gray, and A.J. Drummond, mtDNA variation ...
  • . Stiller, M. et al., Withering away-25, 000 years of ...
  • Kitchen, A., M.M. Miyamoto, and C.J. Mulligan, Utility of DNA ...
  • Emerson, B.C., E. Paradis, and C. Thebaud, Revealing the demographic ...
  • . Ballard, J.W.O. and M.C. Whitlock, The incomplete natural history ...
  • . Demandt, M. and M. Bjorklund, Loss of genetic variability ...
  • . Kumar, S., et al., MEGA: a bio logist-centric software ...
  • . Simonsen, K.L., G.A. Churchill, and C.F. Aquadro, Properties of ...
  • . Fu, Y.-X., Statistical test of neutrality of mutations against ...
  • . Harpending, H.C. et al., Genetic traces of ancient demography. ...
  • . Schneider, S. and L. Excoffier, Estimation of past demographic ...
  • . Harpending, H., Signature of ancient population growth in a ...
  • . Excoffier, L., G. Laval, and S. Schneider, Arlequin (version ...
  • Kruskal, J.B., Multidimens ional scaling by optimizing goodness of fit ...
  • . Ersts, P., Geographic distance matrix generator (version 1.2. 3). ...
  • . Mantel, N., The detection of disease clustering and a ...
  • . Dixon, P., VEGAN, a package of R functions for ...
  • نمایش کامل مراجع