برآورد میزان تنوع ژنتیکی در ذخیره مولدین فیل ماهی (Huso huso Linnaeus, ۱۷۵۸) با استفاده از داده های حاصل از توالی یابی ژنوم

فیل ماهی به عنوان اصلی ترین گونه پرورشی از ماهیان خاویاری در ایران مطرح بوده که ذخیره مولدین کنونی آن از تعداد محدودی مولد وحشی در دو گذشته ایجاد شده است. فقدان گونه های شناسنامه دار یکی از مهم ترین عوامل محدودکننده در توسعه صنعت آبزی پروری ماهیان خاویاری در ایران بوده است. از این رو، در پروژه حاضر و برای اولین بار از تکنیک توالی یابی مبتنی بر ژنوم[۱] به منظور برآورد تنوع ژنتیکی و تهیه شناسنامه مولکولی مبتنی بر ژنوم از ذخیره مولدین فیل ماهی موجود در انستیتو ماهیان خاویاری، استفاده شد. توالی یابی ژنومی منجر به تولید GB۲۹۴ داده حاصل از ۲۶۱۹۷۴۴۵۹ خوانش ژنومی شد که در نهایت باعث شناسایی ۱۸۳۶ نشانگر SNP[۲] در ژنوم فیل ماهی شد که بیشترین تعداد آن بر کروموزوم شماره ۵۸ مشاهده شد. نتایج حاصل از تجزیه وتحلیل SNPs کشف شده نشان داد که میزان هتروزیگوسیتی موردمشاهده در ذخیره مولدین فیل ماهی موجود در انستیتو، ۳۵/۰ است. همچنین ۱۰۵ آلل در ذخیره مولدین مورد بررسی یافت شد که بیانگر تنوع آللی مناسب در این گونه بود. نتایج حاصل از روابط هم تباری با استفاده از مارکرهای SNP شناسایی شده برای اولین بار نشان داد که ذخیره ژنتیکی مولدین فیل ماهی در انستیتو در دو خوشه ژنتیکی، قابل تقسیم بندی هستند. میزان همخونی در مولدین فیل ماهی مورد بررسی ۰۲/۰ برآورد گردید که این میزان پایین همخونی در کنار ساختار جمعیتی مختلط مورد مشاهده در آزمون PCA می تواند بیانگر تنوع بالا در مولدین وحشی ایجادکننده جمعیت حاضر باشد. با توجه به دسترسی بسیار محدود به مولدین وحشی برای غنی سازی خزانه ژنی گله های پرورشی، پیشنهاد می گردد تا با استفاده از روش های نوین مبتنی بر ژنومیکس در زمینه شناسایی خزانه های ژنی، حفظ ساختارهای ژنتیکی و تکثیر هدفمند بر اساس اطلاعات ژنتیکی در بازسازی ذخایر و آبزی پروری اقدام گردد. [۱] Genotyping-by sequencing[۲] Single nucleotide polymorphism (SNP)

کلیدواژه ها:

چندشکلی تک نوکلئوتیدی ، خزانه ژنی ، درون آمیزی ، ژنومیکس ، ماهیان خاویاری