مطالعات بیوانفورماتیک برخی ترکیبات ترپنی اسانس خانواده نعناییان برروی آنزیمهای سم زدایی حشره بید سیب زمینی

استفاده بیش از حد از سموم و آفت کشها برای کنترل آفات گیاهی و محصولات کشاورزی منجر به مقاومت این آفات در برابر سموم شده که تهدیدی برای سلامت عمومی قلمداد می شود. هدف از این مطالعه بررسی اثر مهار کنندگی برخی ترکیبات مهم ترپنی اسانس گیاهی، برای مهار آنزیمهای سم زدایی گلوتاتیون S ترانسفرازها (GST) و سیتوکروم CYP) P۴۵۰) در محیط in silico می باشد. در این مطالعه لیگاندهایی با تمایل بالا نسبت به رزیدوهای جایگاه فعال آنزیمهای هدف با استفاده از گلاید داکینگ شناسایی شدند تا برای محاسبات بیشتر براساس روش القای قالب با استفاده از نرم افزار شرودینگر مورد تجزیه و تحلیل قرار بگیرند به این منظور نخست ساختار ترکیبات ترپنی اسانس گیاهی و آنزیم های مورد بررسی به ترتیب از پایگاههای PubChem و PDB دریافت شدند. برای انجام داکینگ مولکولی و برهمکنش میان ترکیبات گیاهی و آنزیم های مورد نظر از محیط های Discovery Studio Chimera ۱.۱۴، ViewerLite ۱.۵.۶-AutoDockTools و AutoDock Vina استفاده شد. در نهایت نتایج با استفاده از برنامه های Ligplot, Chimera UCSF مورد آنالیز قرار گرفت. پتانسیل مهار آنزیم ها نشان دادند ترکیبات هومولن - کاریوفیلن و کادینول بیشترین برهمکنش را با CYP و GST نشان دادند. بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات داکینگ این ترکیبات با منفی ترین سطح انرژی اتصال تمایل بیشتری برای اتصال به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال هر دو آنزیم مورد مطالعه دارد بنابراین ترکیبات مذکور می توانند به عنوان نامزدهای بسیار مناسبی برای بررسی آزمایشگاهی و in vivo فعالیت ضد حشره محسوب شوند.

کلیدواژه ها:

ترکیبات ترپنی ، داکینگ ، سیتوکروم P۴۵۰ ، گلوتاتیون -Sترانسفراز