ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک زرد جو در استان خراسان رضوی، ایران

گرامی نوقابی، م. (۱۴۰۳). ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک زرد جو در استان خراسان رضوی، ایران. دانش بیماری­شناسی گیاهی، ۱۴ (۱): ۸-۱.  موزاییک زرد ناشی از ویروس موزاییک زرد جو (Barley Yellow Mosaic Virus=BaYMV)، که توسط شبه قارچ Polymyxa graminis منتقل می­شود، یکی از بیماریهای مهم ویروسی جو در جهان است.  برای ردیابی سرولوژیکی و مولکولی این ویروس از مزرعه­های جو استان خراسان رضوی، شمال شرق ایران، ۸۶ نمونه برگ به صورت تصادفی و یا دارای علایمی شامل موزاییک، زردی و رگبرگ روشنی در اوخر زمستان سال ۱۴۰۰، جمع ­آوری شدند. نمونه ها پس از انتقال به آزمایشگاه توسط آزمون های سرولوژیکی الایزا و مولکولی واکنش زنجیره ای پلیمراز- ترانسکریپتاز معکوس (RT-PCR) مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی BaYMV طراحی شده، قطعه ای به طول ۸۰۰  جفت باز مربوط به پروتیین پوششی ویروس تکثیر شد. از بین جدایه های مثبت آزمون RT-PCR، قطعه دی ان ا تکثیر شده مربوط به جدایه بجستان پس از استخراج از ژل، تعیین توالی گردید. توالی دریافتی جدایه بجستان , BaYMV پس از تایید صحت  با استفاذه از برنامه بلاست، به همراه سایر توالی های پروتیین پوششی  BaYMV موجود در بانک ژن NCBI به وسیله نرم افزارهای DNAMAN-۷ و Vector NTI مورد واکاوی فیلوژنتیکی قرار گرفت. قطعه تعیین توالی شده جدایه بجستان دارای بیشترین شباهت در سطح نوکلئوتیدی (۷۹/۹۴ درصد) و آمینواسیدی (۵۹/۹۰ درصد) با قطعه مشابه یک جدایه از اروپا بود. این اولین گزارش وقوع BaYMV از شهرستان بجستان استان خراسان رضوی ایران است.

کلیدواژه ها:

BaYMV ، Coat protein ، ELISA ، RT-PCR ، پروتیین پوششی ، BaYMV ، ELISA ، RT-PCR