مدل سازی ساختار سه بعدی پروتئین گلوتاتیون اس ترانسفراز جدا شده از شیگلا دیسانتری

با­توجه به ­اینکه پروتئین­ها، مولکول­های عملکردی سلول­های زنده می­باشند، داشتن آگاهی از نحوه­ی عملکرد آن­ها می­تواند موثر باشد. از جمله عوامل مهم و موثر در عملکرد پروتئین­ها، ساختار سه بعدی آن­ها می­باشد. آنزیم گلوتاتیون اس-ترانسفراز، یکی از پروتئین­های موجود در سلول­های زنده می­باشد که در عمل انتقال دادن و سم زدایی ترکیبات بیگانه زیست شرکت دارد. در این مطالعه، ساختار سه بعدی پروتئین گلوتاتیون اس ترانسفراز جدا شده از شیگلا دیسانتری که به روش تجربی تعیین ساختار نشده است با کمک همترازی با توالی­های اشرشیا کلی سویه K۱۲  با برنامه­ی Swiss model شبیه سازی شد. نتیجه­ی همترازی انجام شده نشان داد که ژن گلوتاتیون اس ترانسفراز  در مقایسه با ژن انسانی ۸۴ درصد شباهت را دارد. هچنین نتایج نشان دادند که لوسین، اسید آمینه سازنده­ی این پروتئین بود که نسبت به سایر اسید آمینه­های دیگر، میزان بیشتری از ترکیب پروتئین را به خود اختصاص داده بود. به منظور بررسی کیفیت مدلسازی، مقدار میانگین مربعی محاسبه شد، که در مدل مورد نظر ۴۷/۰ آنگستروم بود که این مقدار کمتر از ۱ بود که نشان دهنده مناسب بودن مدل طراحی شده می باشد. با تعیین و پیش بینی ساختار و مدل سازی آنزیم­ها می­توان به بررسی برهمکنش­های بین دنباله­ها وسوبسترای آن­ها پرداخت و در زمینه­ی ساخت دارو­ها و واکسن­ها از روش­های مدل سازی بیوانفورماتیکی استفاده موثر کرد.

کلیدواژه ها:

اشرشیا کلی ، شیگلا دیسانتری ، گلوتاتیون اس-ترانسفراز ، Swiss modelSwiss model