mtDNA marker reveals the first record of Sepiella japonica (Sasaki, ۱۹۲۹) in the marine waters of Pakistan

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 117

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_INJBIR-1-1_002

تاریخ نمایه سازی: 26 مرداد 1404

چکیده مقاله:

Cephalopods are the most intelligent, mobile and also the largest of all mollusks, with all members marine. Cuttlefish is a valuable fishery source and is used as human food because of its high nutritive value. Previously, only one Sepiidae species, Sepiella inermis, had been reported in Pakistan. Morphological species identification is now being replaced by molecular-based approaches due to their fast and reliable results. Here, we used mitochondrial fragments, cytochrome c oxidase I (COI) to investigate whether Sepiella japonica could be identified by the DNA barcoding technique. In the present investigation, a ۵۸۸ bp fragment of Cytochrome oxidase subunit ۱ sequence revealed ۹۸.۴۰% identity with S. japonica. The evolutionary distance between the S. japonica from Pakistan and India is ۰.۰۱۲. The neighbor-joining tree showed a close relationship between sequences of this species from India and Pakistan. The S. japonica sequence from this region was submitted to NCBI under accession number ON۴۳۰۶۰۰. To the best of our knowledge, this study is the first that report S. japonica in Pakistani coastal waters. Presence of this commercially important species will be a valuable addition to the Pakistani coastal waters. Molecular information provides important assistance for taxonomic decisions.

نویسندگان

A. Sulaman

Center of Excellence in Marine Biology, University of Karachi, Karachi-۷۵۲۷۰, Pakistan

H.H. Shad

GEOMAR Helmholtz Centre for Ocean Research Kiel, Germany

M. Shafi

Lasbella University of Agriculture, Water and Marine Sciences, Lasbella, Uthal.

M.S. Chang

Department of Science and Technical Education, University of Sindh

F. Muhammad

Center of Excellence in Marine Biology, University of Karachi, Karachi-۷۵۲۷۰, Pakistan

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ashraf, S.A., ۱۹۶۹. On cephalopods of Pakistan. Records of the ...
  • Farhadi, A. and Anderson, F.E., ۲۰۲۱. The Dynasty of the ...
  • Folmer, O., Hoeh, W.R., Black, M.B. and Vrijenhoek, R.C., ۱۹۹۴. ...
  • Guo, B.Y., Ye, Y.Y., Li, J.J., Qi, P.Z., Lv, Z.M., ...
  • Hoving, H.J.T., Perez, J.A.A., Bolstad, K.S., Braid, H.E., Evans, A.B., ...
  • Kadri, K., ۲۰۱۹. Polymerase chain reaction (PCR): principle and applications. ...
  • Kalhoro, M.A., Tang, D., Ye, H.J., Evgeny, M., Wang, S. ...
  • Kazmi, Q.B. and Shimura, J., ۲۰۰۳. Taxonomic studies of crustaceans ...
  • Kazmi, Q.B., Moazzam, M. and Sultana, R., ۲۰۱۸. Marine molluscan ...
  • Kim, E, Lee, SR, Lee, CI, Park, H. and Kim ...
  • Lei, S., Zhang, X., Liu, S. and Chen, S., ۲۰۱۲. ...
  • Li, J., Ye, Y., Wu, C., Guo, B. and Gul, ...
  • Li, Y., Cao, Z., Li, H., Liu, H., Lü, Z. ...
  • Liu, H.S. and Chen, X.J., ۲۰۰۲. Study on water temperature ...
  • Lü, Z., Yao, C., Zhao, S., Zhang, Y., Gong, L., ...
  • Majid, A. and Khailuddin, M., ۱۹۹۲. Economic role of Pakistan's ...
  • Moazzam, M. and Ahmed, J., ۱۹۹۴. Prospects of development of ...
  • Packer, L., Gibbs, J., Sheffield, C. and Hanner, R., ۲۰۰۹. ...
  • Rashad, M., Ayub, Z. and Siddiqui, G., ۲۰۱۰. Morphometric relationships ...
  • Sambrook, J. and Russell, D.W., ۲۰۰۱. Molecular Cloning: A Laboratory ...
  • Sanchez, G., Setiamarga, D.H., Tuanapaya, S., Tongtherm, K., Winkelmann, I.E., ...
  • Soomro, S.H., Qun, L., Kalhoro, M.A., Memon, K.H., Kui, Z. ...
  • Taberlet, P., Coissac, E., Pompanon, F., Brochmann, C. and Willerslev, ...
  • Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. and Kumar, ...
  • Voss, N.A., Vecchione, M., Toll, R.B. and Sweeney, M.J., ۱۹۹۸. ...
  • Wang, L., Li, S., Xu, L., Li, Y., Chen, H. ...
  • Xia, X., ۲۰۱۷. DAMBE۶: new tools for microbial genomics, phylogenetics, ...
  • Xu, R., Lü, Y., Tang, Y., Chen, Z., Xu, C., ...
  • Ye, Y., Yan, C., Xu, K., Li, J., Miao, J., ...
  • Yin, F., Sun, P., Peng, S., Tang, B., Zhang, D., ...
  • Zheng, X., Yang, J., Lin, X. and Wang, R., ۲۰۰۴. ...
  • نمایش کامل مراجع